More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1408 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1408  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  100 
 
 
497 aa  1009    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3107  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
312 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
400 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71017  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543295  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.24 
 
 
320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0161  oligopeptide ABC transporter, permease protein, putative  30.2 
 
 
414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
308 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0776  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  29.58 
 
 
320 aa  114  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429836  hitchhiker  0.000000000000473305 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
306 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000794188  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
307 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
306 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl094  oligopeptide ABC transporter permease component  32.86 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  33.33 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
307 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.810626  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
307 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.86 
 
 
305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
309 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
321 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
320 aa  111  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0445446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
316 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
320 aa  111  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0391  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.88 
 
 
303 aa  110  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.920936  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1617  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  29.44 
 
 
319 aa  110  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.109124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
313 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  32.55 
 
 
305 aa  109  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  29.26 
 
 
306 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
306 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
313 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
306 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
317 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.58 
 
 
331 aa  108  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0713314  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
335 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
324 aa  107  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  28.67 
 
 
321 aa  107  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 
313 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
334 aa  107  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
313 aa  106  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
315 aa  106  8e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.301395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
335 aa  106  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238126  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 
326 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
308 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 
321 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
316 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
320 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
325 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
305 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
319 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
319 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
335 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  29.32 
 
 
321 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
322 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
319 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0569  oligopeptide ABC transporter, permease  30.73 
 
 
321 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2363  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
397 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  0.026678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 
306 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
322 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3533  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  27.68 
 
 
305 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
322 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3876  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  33.81 
 
 
336 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
322 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
321 aa  104  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  30.83 
 
 
298 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0842  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.55 
 
 
297 aa  104  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00690225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
319 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
306 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8933  ABC transporter permease protein  34.48 
 
 
307 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.96 
 
 
333 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
312 aa  103  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
321 aa  103  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.31 
 
 
309 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
306 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.38 
 
 
306 aa  103  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.9 
 
 
340 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0218658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.24 
 
 
306 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1301  oligopeptide ABC transporter, permease protein  27.9 
 
 
309 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1102  oligopeptide ABC transporter permease  27.9 
 
 
309 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1084  oligopeptide ABC transporter, permease  27.9 
 
 
309 aa  103  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1078  oligopeptide ABC transporter, permease  27.9 
 
 
309 aa  103  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1339  oligopeptide ABC transporter, permease protein  27.9 
 
 
309 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000511987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1192  oligopeptide ABC transporter permease protein  27.9 
 
 
309 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1262  oligopeptide ABC transporter, permease protein  27.9 
 
 
309 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
306 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221048  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2031  ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 
313 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381274  normal  0.768388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
355 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0791674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  32.73 
 
 
324 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
325 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
306 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17239  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
306 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.191651  hitchhiker  0.00741174 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
308 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
320 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.94 
 
 
306 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
306 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.94 
 
 
306 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
319 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
335 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.181035 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2063  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
336 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  31.94 
 
 
306 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>