More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0776 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0776  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  100 
 
 
320 aa  645    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429836  hitchhiker  0.000000000000473305 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.69 
 
 
320 aa  379  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.76 
 
 
322 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1617  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  60.94 
 
 
319 aa  372  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.109124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0569  oligopeptide ABC transporter, permease  55.31 
 
 
321 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2028  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  56.88 
 
 
319 aa  365  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D19  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  55.94 
 
 
319 aa  360  1e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.83 
 
 
322 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.8 
 
 
322 aa  345  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0726  oligopeptide ABC transporter, permease protein  53.27 
 
 
322 aa  334  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0715  oligopeptide ABC transporter, permease protein  53.27 
 
 
322 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000364541 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0625  oligopeptide ABC transporter permease  53.27 
 
 
322 aa  334  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0895389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0568  oligopeptide ABC transporter, permease  53.27 
 
 
322 aa  334  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0658  oligopeptide ABC transporter permease protein  53.27 
 
 
322 aa  334  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.975917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0787  oligopeptide ABC transporter, permease protein  53.27 
 
 
322 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0445446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
320 aa  240  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 
326 aa  232  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
326 aa  229  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
321 aa  228  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.26 
 
 
313 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
321 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.71 
 
 
333 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
319 aa  223  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  36.56 
 
 
318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  36.56 
 
 
318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
325 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 
318 aa  222  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  37.42 
 
 
313 aa  222  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 
321 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  36.14 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
313 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
326 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
321 aa  218  8.999999999999998e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
318 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 
321 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
311 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
313 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4538  peptide ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
315 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  36.57 
 
 
307 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 
307 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4215  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.11 
 
 
315 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
313 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
321 aa  215  7e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.34 
 
 
324 aa  215  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  34.69 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
332 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.11 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35 
 
 
318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  35.4 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
316 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 
307 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
313 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
313 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  34.06 
 
 
316 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
318 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
314 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  33.75 
 
 
316 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  34.69 
 
 
306 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 
306 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
313 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
313 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
316 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
316 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  33.63 
 
 
336 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3251  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  33.96 
 
 
312 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177339  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
315 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  36.79 
 
 
314 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
312 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.794004  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 
316 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  34.38 
 
 
306 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
306 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  34.38 
 
 
306 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  34.38 
 
 
306 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.34 
 
 
336 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
321 aa  205  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
321 aa  205  7e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
311 aa  205  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
319 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
313 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
320 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
316 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
320 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
339 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.186938  normal  0.127201 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  33.44 
 
 
316 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.44 
 
 
316 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
318 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
312 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.856468 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
313 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
331 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
320 aa  203  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000461837  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
315 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
335 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
313 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>