246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0161 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0161  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 
360 aa  742    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00204123  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0095  heat-inducible transcription repressor  70.85 
 
 
344 aa  513  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1025  heat-inducible transcription repressor  44.8 
 
 
347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000723404  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  28.9 
 
 
350 aa  172  7.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  26.45 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  27.86 
 
 
352 aa  146  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  26.53 
 
 
343 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1349  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.36 
 
 
341 aa  144  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0115435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  28.61 
 
 
338 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  28.31 
 
 
338 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  28.31 
 
 
338 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  28.31 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  26.55 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  26.55 
 
 
338 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  26.55 
 
 
338 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  26.55 
 
 
338 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  26.55 
 
 
338 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  28.01 
 
 
338 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  25 
 
 
344 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  22.74 
 
 
344 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.32 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.67 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.73 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl417  heat inducible transcription repressor  27.17 
 
 
342 aa  109  8.000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.38 
 
 
337 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.94 
 
 
343 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  21.93 
 
 
347 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.67 
 
 
337 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.86 
 
 
343 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  28.88 
 
 
339 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.43 
 
 
341 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.44 
 
 
337 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.03 
 
 
345 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.08 
 
 
348 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  24.41 
 
 
349 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.51 
 
 
351 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0367  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.36 
 
 
340 aa  100  5e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  26.57 
 
 
351 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.84 
 
 
340 aa  99.8  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  27.38 
 
 
337 aa  99.4  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.18 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.64 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  24 
 
 
344 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.65 
 
 
346 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  25.22 
 
 
339 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.02 
 
 
344 aa  96.3  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  25.97 
 
 
340 aa  95.9  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  25.67 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.27 
 
 
345 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.07 
 
 
343 aa  94  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  23.71 
 
 
339 aa  92.8  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  23.51 
 
 
339 aa  92.8  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  21.69 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.01 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.04 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  23.65 
 
 
349 aa  92  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.45 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.27 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.01 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  22.42 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.15 
 
 
373 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  26.25 
 
 
339 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  23.95 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  26.05 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  23.91 
 
 
340 aa  89.7  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.29 
 
 
343 aa  89.7  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.86 
 
 
359 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.69 
 
 
340 aa  89.4  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  36.31 
 
 
372 aa  89.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  23.91 
 
 
340 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  23.91 
 
 
340 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  26.7 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.22 
 
 
344 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  23.65 
 
 
340 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.69 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0763  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.64 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.94526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.49 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.42 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  24.7 
 
 
343 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  23.62 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.33 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  23.62 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  25.67 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.76 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  21.51 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  23.62 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.22 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.03 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  25.67 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  25.67 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf618  heat-inducible transcription repressor  26.04 
 
 
337 aa  87  4e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.58742  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  24.5 
 
 
339 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.7 
 
 
365 aa  87  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  24.16 
 
 
339 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.97 
 
 
340 aa  86.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.87 
 
 
345 aa  86.3  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0466  heat-inducible transcription repressor  24.71 
 
 
357 aa  86.3  8e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  27.02 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.35 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1242  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.43 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0655276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>