More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4622 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3797  ATPase domain-containing protein  92.72 
 
 		 413 aa  775    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4622  sensor histidine kinase  100 
 
 		 413 aa  853    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4195  histidine kinase A domain-containing protein  83.86 
 
 		 415 aa  710    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4327  histidine kinase A domain-containing protein  84.3 
 
 		 415 aa  716    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4006  histidine kinase A domain-containing protein  79.61 
 
 		 413 aa  648    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0692  histidine kinase A domain-containing protein  53.66 
 
 		 404 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3576  histidine kinase A domain-containing protein  52.3 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  24.45 
 
 		 422 aa  106  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  29.6 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  28.8 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  29.57 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  28.47 
 
 		 431 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  24.21 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  27.64 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  30.36 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  29.29 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  25.84 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  23.79 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  31.05 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  24.44 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0334  histidine kinase  28.8 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000559138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  26.91 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3439  Signal transduction histidine kinase-like  24.11 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359307 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  26.7 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  26.73 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  27.35 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  25.95 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  26.2 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  27.34 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  26.87 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  26.87 
 
 		 573 aa  64.7  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0417  putative sensor kinase protein  28.57 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2585  histidine kinase  25 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  decreased coverage  0.00983118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.36 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  25.86 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1450  histidine kinase  26.01 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  24.41 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3010  histidine kinase A domain-containing protein  23.23 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728657  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  23.43 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  27.17 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3157  histidine kinase  21.28 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0147  signal transduction histidine kinase-like protein  27.5 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  25.36 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  25.57 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3911  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.697647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  25 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  25.72 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  24.84 
 
 		 603 aa  60.1  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.810358  hitchhiker  0.00733319 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2665  histidine kinase  26.11 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  25.9 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  23.94 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  21.92 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1623  sensor histidine kinase  23.94 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  25.62 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  23.94 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  23.94 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  23.94 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  23.94 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  28.31 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  23.11 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0719  sensor histidine kinase  26.58 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2876  putative sensor histidine kinase SrrB  25.82 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  23.83 
 
 		 722 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2861  sensor histidine kinase SrrB  21.61 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.933521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2866  putative sensor histidine kinase SrrB  21.61 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000772439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>