More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3251 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  100 
 
 		 279 aa  577  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  98.57 
 
 		 279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  98.57 
 
 		 279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  98.92 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  97.85 
 
 		 279 aa  569  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  96.77 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  96.77 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  96.77 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  96.77 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  92.83 
 
 		 279 aa  546  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  92.36 
 
 		 277 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  92.36 
 
 		 277 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  89.17 
 
 		 277 aa  517  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  89.89 
 
 		 277 aa  519  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  90.58 
 
 		 277 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  87.64 
 
 		 277 aa  508  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  62.27 
 
 		 276 aa  367  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  62.87 
 
 		 275 aa  360  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  63.24 
 
 		 275 aa  359  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  62.5 
 
 		 275 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  61.4 
 
 		 275 aa  347  9e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  57.25 
 
 		 276 aa  335  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  55.47 
 
 		 280 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  52.88 
 
 		 278 aa  308  8e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  54.38 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  54.74 
 
 		 280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.65 
 
 		 275 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  55.11 
 
 		 275 aa  300  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  53.65 
 
 		 275 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  53.65 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  55.02 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  54.38 
 
 		 274 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  51.12 
 
 		 275 aa  289  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  54.01 
 
 		 274 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  50.93 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  48.35 
 
 		 285 aa  266  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  47.37 
 
 		 278 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  45.96 
 
 		 275 aa  264  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  47.08 
 
 		 275 aa  255  7e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  45.63 
 
 		 271 aa  240  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  48.3 
 
 		 267 aa  228  9e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  41.94 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  41.79 
 
 		 291 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  41.04 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  41.79 
 
 		 292 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  41.64 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  41.03 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  41.03 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  42.25 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  39.34 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  42.32 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  41.2 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  41.04 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  40.07 
 
 		 292 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  38.89 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  40.86 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  38.95 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  39.34 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  39.7 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  40.07 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  40.46 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  38.66 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  35.59 
 
 		 414 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  37.26 
 
 		 316 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  34.67 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.98 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  40.62 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1065  MCP methyltransferase, CheR-type  36.63 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  39.02 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  36.23 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  37.59 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  35.91 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  33.71 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  35.69 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  32.38 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  33.69 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  35.48 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  33.09 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  35.87 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  37.12 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  36.84 
 
 		 269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  35.13 
 
 		 303 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  36.64 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  35.21 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  32.84 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  37.11 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  34.83 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0471  MCP methyltransferase, CheR-type  35.94 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  34.35 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  34.33 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  31.23 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  31.46 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  34.4 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  34.15 
 
 		 280 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  34.46 
 
 		 303 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  33.81 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  32.82 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>