More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2216 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  100 
 
 		 312 aa  635    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  41.58 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  36.33 
 
 		 291 aa  185  7e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  33.67 
 
 		 321 aa  175  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  33.33 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  33.33 
 
 		 321 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  33.33 
 
 		 321 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964628 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  30.95 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  30.95 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  33 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  33 
 
 		 321 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  30.98 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  30.61 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  26.99 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  30.2 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  30.3 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  33.33 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  30.42 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  29.31 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  29.63 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  25.34 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  28.24 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  25.09 
 
 		 327 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  24.56 
 
 		 374 aa  95.9  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  24.83 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  24.81 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  25.98 
 
 		 306 aa  85.9  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  28.04 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  27.1 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  29.93 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1475  ribokinase-like domain-containing protein  24.4 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  24.84 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  25.9 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  25.84 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  25.45 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  25.16 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  26.21 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  26.87 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  25.26 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  27.33 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  25.89 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  24.33 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  25.07 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  23.89 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  27.6 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  25.86 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  23.26 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  35.58 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  26.44 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  25 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  25 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  25 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  24.69 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  28.16 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  28.16 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  25.77 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  28.16 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  25.93 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  22.97 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  23.02 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  23.02 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  23.02 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  23.02 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  23.02 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  25.24 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0329  ribokinase-like domain-containing protein  25.09 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.810022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  23.18 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  22.73 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  25.58 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  25.64 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  25.5 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  25.5 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  22.07 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  25.74 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  22.26 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  23.3 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  25 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.9 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  23.89 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  24.57 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  25.08 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  26.41 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  25.08 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  25.08 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  25.77 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  23.86 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  24.92 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.76 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  25.75 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  25.61 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  25.61 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  24.83 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  27.96 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  24.75 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  21.84 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  24.67 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  24.53 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>