More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1799 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 145 aa  302  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  93.79 
 
 		 145 aa  290  5e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  93.79 
 
 		 145 aa  290  5e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  70.34 
 
 		 145 aa  214  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  67.59 
 
 		 145 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  65.52 
 
 		 145 aa  201  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  61.38 
 
 		 148 aa  196  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  60.69 
 
 		 145 aa  192  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 147 aa  190  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  60.42 
 
 		 148 aa  188  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  60.42 
 
 		 148 aa  187  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 147 aa  187  5.999999999999999e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 147 aa  180  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 146 aa  179  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 148 aa  176  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  56.74 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 147 aa  174  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000674786  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 144 aa  170  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 144 aa  170  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 147 aa  170  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 143 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 147 aa  169  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 149 aa  169  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  54.61 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 147 aa  169  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 144 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 147 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 147 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  53.9 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  51.8 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  54.68 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 151 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  54.35 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 145 aa  166  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 143 aa  166  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>