More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1725 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 358 aa  726    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  93.02 
 
 		 358 aa  684    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  93.02 
 
 		 358 aa  684    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  66.67 
 
 		 355 aa  491  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  65.53 
 
 		 355 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  65.24 
 
 		 358 aa  484  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  65.24 
 
 		 358 aa  484  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  65.24 
 
 		 358 aa  484  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  65.53 
 
 		 358 aa  485  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  65.53 
 
 		 355 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  65.24 
 
 		 358 aa  484  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  65.24 
 
 		 358 aa  484  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  65.53 
 
 		 358 aa  485  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  65.53 
 
 		 355 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  64.04 
 
 		 358 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  58.71 
 
 		 362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  64.43 
 
 		 358 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  57.66 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  57.66 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 		 362 aa  429  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  58.59 
 
 		 357 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  58.07 
 
 		 356 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 356 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 357 aa  423  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  56.74 
 
 		 359 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 		 360 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  56.74 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  60.51 
 
 		 356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 		 356 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  57.7 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  58.03 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  56.74 
 
 		 359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  56.18 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  57.42 
 
 		 359 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  55.4 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 		 354 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  56.37 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  55.21 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 		 357 aa  391  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  55.37 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0615  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  57.01 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  54.57 
 
 		 363 aa  388  1e-106  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  52.39 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  57.32 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  56.4 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 367 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 363 aa  381  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  55.99 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  52.6 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  52.6 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  54.29 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  52.79 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  51.54 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  51.81 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  51.81 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  51.54 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  51.54 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  51.25 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  52.29 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  54.05 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  51.54 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  51.86 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  53.76 
 
 		 361 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 363 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 362 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>