More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1110 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  77.78 
 
 		 207 aa  337  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  77.78 
 
 		 207 aa  337  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  41.23 
 
 		 209 aa  151  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  41.23 
 
 		 209 aa  151  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  38.68 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0522  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.2 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  40.76 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  40.28 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  40.28 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  41.71 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  40.28 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  40.28 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  40.28 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  40.28 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  40.28 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0860  metallo-beta-lactamase family protein  39.17 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  37.91 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  35.68 
 
 		 206 aa  138  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  35.68 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  37.2 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.19 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  37.19 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  37.19 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  35.55 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  35.5 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  36.5 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.02 
 
 		 211 aa  128  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  35.5 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  35.71 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  35.71 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  35.24 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  35.68 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  34.76 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  37.84 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  34.63 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  36.15 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.93 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 222 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.08 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  31.55 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.67 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.01 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  35.5 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.01 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  34.98 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  34.83 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.01 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.01 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.01 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.3 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1074  glyoxalase II family protein  37.37 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.905224  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  35.96 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  36.63 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  36.32 
 
 		 222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 		 215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  36.17 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  36.17 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  34.3 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 		 221 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  30.29 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  34.78 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  32.86 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  32.68 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  35.12 
 
 		 214 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0544  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.591388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  34.6 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  34.5 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  35.12 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  30.52 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  35.9 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>