More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0683 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.73 
 
 		 468 aa  908    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 468 aa  940    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.22 
 
 		 470 aa  709    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.24 
 
 		 470 aa  692    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.24 
 
 		 470 aa  693    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.24 
 
 		 470 aa  693    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.24 
 
 		 470 aa  693    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.24 
 
 		 470 aa  692    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.24 
 
 		 470 aa  692    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.02 
 
 		 470 aa  691    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.24 
 
 		 470 aa  693    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.73 
 
 		 468 aa  908    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.94 
 
 		 470 aa  694    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.16 
 
 		 470 aa  708    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.24 
 
 		 470 aa  693    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.24 
 
 		 470 aa  693    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.36 
 
 		 459 aa  598  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.77 
 
 		 470 aa  568  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.39 
 
 		 473 aa  513  1e-144  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.45 
 
 		 475 aa  504  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.66 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0740  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.27 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010396  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.64 
 
 		 492 aa  428  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.53 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.73 
 
 		 616 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.53 
 
 		 475 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.53 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.62 
 
 		 481 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.68 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.25 
 
 		 484 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.55 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.27 
 
 		 593 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.04 
 
 		 484 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.73 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.2 
 
 		 475 aa  388  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 		 607 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.04 
 
 		 603 aa  378  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.66 
 
 		 602 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.37 
 
 		 474 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 		 464 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.84 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.84 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.63 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.2 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.84 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.71 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2665  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  43.98 
 
 		 589 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2610  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  43.98 
 
 		 589 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.63 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.63 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1719  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  44.2 
 
 		 589 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0421  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.15 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000187748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1500  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  44.2 
 
 		 589 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2743  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  43.98 
 
 		 589 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2153  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.62 
 
 		 590 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.63 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2228  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  44.2 
 
 		 589 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.467573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.59 
 
 		 625 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3092  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  44.2 
 
 		 589 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3429  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.27 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0358795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.63 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 		 464 aa  372  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.61 
 
 		 603 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5942  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.62 
 
 		 588 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1468  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.54 
 
 		 685 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0186247  normal  0.515746 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2135  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.62 
 
 		 588 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.93 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.93 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.86 
 
 		 593 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.18 
 
 		 592 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.77 
 
 		 463 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.93 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2589  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 		 600 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  decreased coverage  0.000383256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1135  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.15 
 
 		 589 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5441  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.01 
 
 		 588 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.93 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.93 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.05 
 
 		 475 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.51 
 
 		 680 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.14 
 
 		 603 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110052  normal  0.0211512 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.2 
 
 		 476 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.93 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.71 
 
 		 475 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.93 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.2 
 
 		 476 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2172  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.18 
 
 		 588 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6503  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.18 
 
 		 592 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.120205  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.93 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.71 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 		 476 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.14 
 
 		 588 aa  365  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 		 476 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.71 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.2 
 
 		 476 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 464 aa  365  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>