164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3066 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3066  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 		 275 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3062  FAD linked oxidase-like protein  45.49 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1024 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1024 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  30.04 
 
 		 1015 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1015 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  25.95 
 
 		 1000 aa  73.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.65 
 
 		 989 aa  73.2  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  37.61 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1509  oxidoreductase, FAD-binding  35 
 
 		 1018 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.0000155929 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  34.17 
 
 		 1018 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  34.17 
 
 		 1018 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1691  FAD linked oxidase domain protein  35.14 
 
 		 1019 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.17 
 
 		 1018 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1018 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  34.17 
 
 		 1018 aa  56.6  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  34.17 
 
 		 1018 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  34.17 
 
 		 1018 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  34.17 
 
 		 1018 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0186702 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  33.66 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  39.42 
 
 		 584 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2755  FAD linked oxidase domain protein  33.93 
 
 		 1017 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.190253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  39.58 
 
 		 552 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1747  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1018 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.43 
 
 		 550 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  33.66 
 
 		 563 aa  52.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.27 
 
 		 510 aa  52.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.67 
 
 		 409 aa  52.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  37.93 
 
 		 1013 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.52 
 
 		 484 aa  52.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  35.19 
 
 		 572 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1477  FAD linked oxidase domain protein  37.08 
 
 		 1018 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065688 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1461  FAD linked oxidase domain protein  37.08 
 
 		 1018 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.236754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  36.7 
 
 		 520 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2453  FAD linked oxidase domain protein  33.04 
 
 		 1017 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999389  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.94 
 
 		 488 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1807  FAD linked oxidase  37.08 
 
 		 1018 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354547  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1978  FAD linked oxidase  37.08 
 
 		 1018 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000994047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1496  FAD linked oxidase  37.08 
 
 		 1018 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237885  hitchhiker  0.00132557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 1005 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.5 
 
 		 568 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4493  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 		 1006 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1593  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.21 
 
 		 1013 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125155  normal  0.43288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1419  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 1006 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  32.38 
 
 		 497 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1845  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 1018 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46355  predicted protein  34.81 
 
 		 458 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111321  normal  0.450226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  35.58 
 
 		 554 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1739  oxidase, FAD binding  31.25 
 
 		 1018 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09066  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) (AFU_orthologue; AFUA_7G02560)  22.8 
 
 		 601 aa  49.7  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.7 
 
 		 523 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.37 
 
 		 531 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1668  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.85 
 
 		 1013 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157229  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  36.08 
 
 		 1009 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.62 
 
 		 557 aa  49.3  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5785  FAD linked oxidase-like  32.61 
 
 		 1018 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6150  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.61 
 
 		 1018 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  33.13 
 
 		 470 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0818  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1021 aa  49.3  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.103467  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.45 
 
 		 516 aa  49.3  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2596  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1018 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  37.66 
 
 		 1013 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1737  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.91 
 
 		 1013 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.187765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2487  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.51 
 
 		 1013 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1864  FAD linked oxidase domain protein  39.51 
 
 		 1013 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23854  hitchhiker  0.000000575821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2242  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.51 
 
 		 1013 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2600  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.51 
 
 		 1013 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.575227  normal  0.0164973 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6630  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.5 
 
 		 1018 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31583  mitochondrial D-lactate ferricytochrome c oxidoreductase  36.36 
 
 		 612 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  32.43 
 
 		 1021 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  27.44 
 
 		 497 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.03 
 
 		 516 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3999  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.28 
 
 		 1006 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316797 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6039  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.46 
 
 		 1017 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5809  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.08 
 
 		 1017 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7704  FAD linked oxidase  37.18 
 
 		 1017 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  33.94 
 
 		 517 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2480  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.27 
 
 		 1013 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  31.11 
 
 		 538 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.39 
 
 		 459 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  27.67 
 
 		 472 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  30.56 
 
 		 497 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.56 
 
 		 497 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.14 
 
 		 1024 aa  46.2  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02063  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1011 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  22.55 
 
 		 460 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  33.33 
 
 		 477 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1872  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36 
 
 		 1019 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000561674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  26.5 
 
 		 556 aa  45.4  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  36.9 
 
 		 978 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1044  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1031 aa  45.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003726  Fe-S oxidoreductase  28.85 
 
 		 1011 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000740961  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1220  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.98 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.234885 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0491  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.45 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.680472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  23.26 
 
 		 472 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.96 
 
 		 1015 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  29.23 
 
 		 1010 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  27.39 
 
 		 499 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2176  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.8 
 
 		 1018 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0114816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4607  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 		 1017 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173184  normal  0.281232 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>