More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3062 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3062  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 		 387 aa  746    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3066  FAD linked oxidase-like protein  45.49 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  26.56 
 
 		 1015 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  32.29 
 
 		 1024 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  33.54 
 
 		 1024 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1015 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  32.39 
 
 		 1000 aa  90.1  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.71 
 
 		 989 aa  87  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3033  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.69 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491318  normal  0.0473445 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.68 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4582  FAD linked oxidase domain protein  29.76 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000242662  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0394  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.88 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.413776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2896  FAD-binding oxidoreductase/transferase  24.72 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  31.79 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  27.59 
 
 		 483 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.54 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0690  FAD linked oxidase-like  26.03 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.895548  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.47 
 
 		 502 aa  67  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4383  FAD linked oxidase domain protein  26.11 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.471447  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  30.41 
 
 		 495 aa  67  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4325  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.02 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73889  normal  0.0799258 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.73 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0494  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.21 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  32.83 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.32 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  29.23 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  28.87 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  28.35 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.49 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  30.68 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.87 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.11 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.92 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  29.08 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  29.85 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0884  FAD linked oxidase domain protein  29.23 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  27.84 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  28.87 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0923  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.72 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0282812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2550  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.09 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.53 
 
 		 890 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.49 
 
 		 459 aa  62.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  27.94 
 
 		 480 aa  62.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.69 
 
 		 479 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.23 
 
 		 493 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1020  putative glycolate oxidase subunit protein  26.38 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0835602  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2680  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.38 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152379 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.06 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  29.08 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0859  FAD linked oxidase domain protein  28.72 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2502  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.11 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.207618  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  24.07 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_004310  BR1410  oxidoreductase, FAD-binding  29.27 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.06 
 
 		 488 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  29.5 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  26.4 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3010  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.44 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.02 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  28.14 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  31.46 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1366  oxidoreductase, FAD-binding  29.7 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.866723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.08 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  29.17 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  27.17 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.57 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1084  FAD linked oxidase domain protein  29.73 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  32.76 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.07 
 
 		 516 aa  59.7  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0208  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.29 
 
 		 477 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23565 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.44 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  29.12 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.85 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.33 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.44 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5973  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.1 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  25.88 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  25.9 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  25.41 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  30.95 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1118  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.64 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.410973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  29.94 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.94 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.71 
 
 		 1005 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.89 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  26.94 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.94 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  29.76 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.12 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  28.57 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.59 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  29.15 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  28.37 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  28.88 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.94 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.59 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28 
 
 		 497 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  26.97 
 
 		 563 aa  57  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.94 
 
 		 990 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  30.95 
 
 		 475 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.81 
 
 		 494 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>