More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2983 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.11 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  56.05 
 
 		 229 aa  241  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 237 aa  232  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 		 237 aa  232  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  48.67 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  49.56 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  49.56 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  49.56 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  51.75 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 234 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.23 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  54.3 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.35 
 
 		 234 aa  228  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  53.6 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  47.79 
 
 		 237 aa  225  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  50.45 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.12 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.13 
 
 		 230 aa  221  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.68 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.79 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  54.5 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  51.11 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 231 aa  218  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  52.49 
 
 		 230 aa  218  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  50.9 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.19 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.33 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  52.63 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 229 aa  214  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 231 aa  214  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 226 aa  214  9e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.94 
 
 		 225 aa  213  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  51.32 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  50.66 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  48.47 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  48.2 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  49.55 
 
 		 229 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.62 
 
 		 237 aa  211  4.9999999999999996e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  48.72 
 
 		 250 aa  211  5.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.68 
 
 		 223 aa  211  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  48.89 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.09 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  50.66 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 226 aa  211  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  50.66 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 242 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  50.22 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  50.22 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  50.22 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  50.22 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  50.22 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  50.22 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  50.22 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  47.56 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  50.66 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  46.85 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  46.85 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  46.85 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  48.89 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  46.4 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  50.66 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  50.66 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  50.66 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  46.4 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  50.66 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>