More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1423 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  100 
 
 		 344 aa  685    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  70.61 
 
 		 346 aa  495  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  69.85 
 
 		 383 aa  494  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  71.17 
 
 		 341 aa  497  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  71.43 
 
 		 350 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  71.88 
 
 		 347 aa  495  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  70.73 
 
 		 345 aa  497  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  70.43 
 
 		 345 aa  495  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  70.3 
 
 		 365 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  72.26 
 
 		 368 aa  492  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  68.79 
 
 		 350 aa  491  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  68.04 
 
 		 350 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  70.9 
 
 		 348 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  70.12 
 
 		 347 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  70.86 
 
 		 345 aa  490  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  68.4 
 
 		 367 aa  488  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  67.45 
 
 		 350 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  70.59 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  71.17 
 
 		 350 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  69.28 
 
 		 361 aa  484  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  70.43 
 
 		 352 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  71.65 
 
 		 338 aa  485  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  70.61 
 
 		 355 aa  484  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  71.03 
 
 		 379 aa  484  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  70.12 
 
 		 347 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  69.21 
 
 		 359 aa  485  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  70.12 
 
 		 347 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  69.28 
 
 		 424 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  70.12 
 
 		 347 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  69.82 
 
 		 366 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  71.65 
 
 		 338 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  69.85 
 
 		 347 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  70.15 
 
 		 364 aa  485  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  70.21 
 
 		 343 aa  482  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  69.11 
 
 		 343 aa  482  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  68.98 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  65.28 
 
 		 347 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  70.39 
 
 		 366 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  70.55 
 
 		 348 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  68.4 
 
 		 348 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  65.28 
 
 		 347 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  69.02 
 
 		 376 aa  481  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  70.18 
 
 		 360 aa  481  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  66.77 
 
 		 352 aa  481  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  66.77 
 
 		 352 aa  482  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  69.63 
 
 		 347 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  68.62 
 
 		 378 aa  481  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  67.45 
 
 		 350 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  69.54 
 
 		 345 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  70.99 
 
 		 347 aa  479  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  65.57 
 
 		 364 aa  478  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  68.54 
 
 		 355 aa  478  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  71.2 
 
 		 356 aa  479  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  70.79 
 
 		 360 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  69.66 
 
 		 418 aa  478  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  67.38 
 
 		 357 aa  478  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  71.15 
 
 		 357 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  66.38 
 
 		 364 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  68.6 
 
 		 362 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  67.47 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  68.34 
 
 		 342 aa  476  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  67.48 
 
 		 349 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  68.4 
 
 		 351 aa  475  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  68.07 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  66.97 
 
 		 363 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  68.29 
 
 		 361 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  71.29 
 
 		 336 aa  471  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  66.36 
 
 		 347 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  67.68 
 
 		 352 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  65.95 
 
 		 347 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  67.08 
 
 		 343 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  71.79 
 
 		 365 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  68.48 
 
 		 359 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  67.77 
 
 		 361 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  67.88 
 
 		 390 aa  471  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  66.87 
 
 		 346 aa  473  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  67.48 
 
 		 363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  67.08 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  70.46 
 
 		 379 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  68.71 
 
 		 348 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  64.91 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  68.5 
 
 		 347 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  69.97 
 
 		 349 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  66.67 
 
 		 363 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  67.17 
 
 		 362 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  70 
 
 		 357 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  66.36 
 
 		 358 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  65.6 
 
 		 351 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  66.97 
 
 		 358 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  70.29 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  66.36 
 
 		 348 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  66.36 
 
 		 348 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  67.55 
 
 		 345 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  67.48 
 
 		 341 aa  464  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  65.77 
 
 		 364 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  67.19 
 
 		 357 aa  468  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  66.37 
 
 		 363 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  67.55 
 
 		 345 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  66.57 
 
 		 362 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  65.95 
 
 		 356 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>