More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1340 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 424 aa  844    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 423 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 420 aa  359  4e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 423 aa  356  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 423 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 423 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 433 aa  351  1e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 419 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 421 aa  350  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 424 aa  349  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 424 aa  349  6e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 424 aa  349  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  44.55 
 
 		 424 aa  349  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 424 aa  349  6e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 424 aa  349  6e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 424 aa  349  6e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 424 aa  349  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 424 aa  349  7e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 424 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 424 aa  346  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 424 aa  346  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 415 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 424 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 424 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 414 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 414 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 419 aa  343  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 424 aa  342  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 423 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 430 aa  339  7e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 419 aa  338  9e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 424 aa  337  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 429 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 429 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 419 aa  333  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 423 aa  333  4e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 427 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 429 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 426 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 420 aa  331  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 414 aa  330  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 413 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 429 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 429 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 425 aa  330  4e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 429 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 422 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 416 aa  328  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 445 aa  328  8e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 435 aa  328  9e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  41.55 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 430 aa  325  8.000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 414 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 417 aa  325  9e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 422 aa  323  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 426 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 426 aa  323  4e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 426 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 426 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  45.08 
 
 		 421 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 430 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>