More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1324 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1324  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 355 aa  705    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.211473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.91 
 
 		 347 aa  411  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.2 
 
 		 344 aa  408  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.7 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.67 
 
 		 355 aa  404  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.8 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 342 aa  401  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.01 
 
 		 336 aa  398  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.08 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  60.54 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.43 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 351 aa  395  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.9 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.57 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  59.87 
 
 		 342 aa  393  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.88 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.52 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.76 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.27 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 345 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.8 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0149  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 		 369 aa  388  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 337 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 338 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 		 346 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.63 
 
 		 332 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.5 
 
 		 333 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.5 
 
 		 333 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.95 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.22 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.05 
 
 		 348 aa  384  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.05 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 		 355 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.64 
 
 		 345 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 333 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.11 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  60.71 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.19 
 
 		 541 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.05 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.13 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.56 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.26 
 
 		 345 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.05 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0928  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.02 
 
 		 354 aa  381  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.32 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 		 355 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0172  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.42 
 
 		 339 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.719394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.81 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.64 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2371  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0333  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.693851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2138  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.66 
 
 		 346 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3181  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.37 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.63 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 333 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.83 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0049  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 332 aa  381  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.603347  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.75 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 		 341 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3205  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 		 334 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0751  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 351 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.44 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.73 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.95 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.82 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 		 343 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.82 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>