More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3983 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  69.17 
 
 		 569 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  98.92 
 
 		 557 aa  1089    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  67.74 
 
 		 570 aa  722    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  100 
 
 		 557 aa  1102    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.31 
 
 		 596 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  47.84 
 
 		 541 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  43.58 
 
 		 547 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  46.27 
 
 		 544 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  48.21 
 
 		 539 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  45.7 
 
 		 597 aa  445  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  45.9 
 
 		 538 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  45.26 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  45.22 
 
 		 546 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  44.32 
 
 		 571 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  43.3 
 
 		 588 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 607 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  45.66 
 
 		 547 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  47.65 
 
 		 534 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  45.52 
 
 		 603 aa  438  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  47.36 
 
 		 539 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1182  ABC transporter related  47.65 
 
 		 569 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  47.09 
 
 		 534 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  46.94 
 
 		 545 aa  435  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  47.17 
 
 		 539 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  48.79 
 
 		 585 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  44.69 
 
 		 562 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3157  ABC transporter for oligopeptide ATP-binding protein  42.2 
 
 		 587 aa  435  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  46.75 
 
 		 542 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  44.11 
 
 		 593 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  42.72 
 
 		 530 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  45.03 
 
 		 534 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  44.94 
 
 		 573 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  42.72 
 
 		 530 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  42.5 
 
 		 610 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  45.47 
 
 		 537 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  44.18 
 
 		 545 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  45.64 
 
 		 557 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 536 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  44.34 
 
 		 536 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  45.66 
 
 		 545 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  46.38 
 
 		 542 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  43.01 
 
 		 599 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  45.76 
 
 		 537 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.57 
 
 		 564 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  42.78 
 
 		 543 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  46.07 
 
 		 547 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  42.38 
 
 		 619 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.57 
 
 		 590 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  45.05 
 
 		 595 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  43.01 
 
 		 601 aa  428  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  42.14 
 
 		 601 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  43.34 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  45.24 
 
 		 544 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  45.91 
 
 		 552 aa  428  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  42.96 
 
 		 543 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  44.65 
 
 		 563 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  43.88 
 
 		 525 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  45.76 
 
 		 537 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  45.15 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  45.4 
 
 		 536 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  45.15 
 
 		 554 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.69 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  47.75 
 
 		 540 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  45.09 
 
 		 543 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.88 
 
 		 555 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.73 
 
 		 568 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  46.35 
 
 		 619 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  46.68 
 
 		 565 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.76 
 
 		 536 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  43.78 
 
 		 640 aa  425  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  45.72 
 
 		 558 aa  425  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  46.46 
 
 		 530 aa  423  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 540 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 		 536 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.31 
 
 		 525 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  44.72 
 
 		 527 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  46 
 
 		 542 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  45.08 
 
 		 613 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  42.96 
 
 		 623 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  43.28 
 
 		 640 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.79 
 
 		 531 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  43.1 
 
 		 583 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  42.53 
 
 		 593 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.4 
 
 		 534 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  43.8 
 
 		 539 aa  422  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  45.24 
 
 		 544 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  44.28 
 
 		 542 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  44.19 
 
 		 556 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  42.46 
 
 		 564 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  43.35 
 
 		 571 aa  422  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  41.21 
 
 		 619 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  44.22 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.15 
 
 		 546 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  47.65 
 
 		 539 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  44.6 
 
 		 575 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 		 559 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  45.05 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  46.58 
 
 		 550 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>