67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3464 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  748    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 438 aa  289  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 		 436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  43.44 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 434 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 440 aa  272  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  43 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  43.8 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  40.99 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 441 aa  269  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  44.94 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  43.48 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  43.42 
 
 		 457 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  40.2 
 
 		 408 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 		 444 aa  225  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  43.19 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 420 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 442 aa  222  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 453 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  38.23 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 		 456 aa  209  8e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 464 aa  206  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 442 aa  199  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  38.63 
 
 		 307 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 433 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1213  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  25.8 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  21.07 
 
 		 444 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 429 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  21.56 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.08 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  21.69 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  21.69 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  22.89 
 
 		 408 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 424 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.23 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  24.47 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  20.34 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.89 
 
 		 408 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.08 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.15 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  23.08 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  23.08 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  21.41 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  23.08 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  23.08 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  24.4 
 
 		 441 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  22.49 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 414 aa  42.7  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>