More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0559 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 267 aa  536  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  44.23 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  47.97 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  40.65 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 		 276 aa  178  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  43.5 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  40.98 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  40.08 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0236  alpha/beta hydrolase fold protein  40.98 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  33.6 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0661  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  34.47 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0368056  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_5097  predicted protein  33.96 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104643  normal  0.482624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3502  hypothetical protein  35.88 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0103  alpha/beta hydrolase  26.55 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3272  hypothetical protein  34.55 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43025  predicted protein  27.48 
 
 		 386 aa  96.3  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0408918  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  29.67 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4701  putative hydrolase protein  40.18 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0255091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1657  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1772  lysophospholipase-like protein  20.73 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  26.72 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  23.31 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  26.46 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  26.42 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  32.77 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  26.52 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  29.17 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  26.36 
 
 		 524 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  29.17 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  44.32 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  30.97 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  23.83 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  25.72 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  28.09 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  26.09 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  33.72 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  33.05 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  36.79 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  35.85 
 
 		 322 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  36.79 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  28.06 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.38 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4366  putative esterase  39.76 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  36.28 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  34.23 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  26.72 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  38.05 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  36.26 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8516  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  40.16 
 
 		 337 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  37.74 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 		 301 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  41.03 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  28.32 
 
 		 266 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5615  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  34.48 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 255 aa  52  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  36.79 
 
 		 274 aa  52.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  37.39 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  33.67 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  32.86 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  28.1 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  32.86 
 
 		 336 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  30.36 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  40.24 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  32.86 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  32.86 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  32.86 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  30.69 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  30.43 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  33.87 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>