125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2855 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2855  ClpXP protease specificity-enhancing factor  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.408921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3202  ClpXP protease specificity-enhancing factor  97.58 
 
 		 165 aa  327  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  0.769041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2925  ClpXP protease specificity-enhancing factor  87.88 
 
 		 165 aa  301  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3226  ClpXP protease specificity-enhancing factor  83.73 
 
 		 165 aa  279  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3089  ClpXP protease specificity-enhancing factor  80.72 
 
 		 162 aa  264  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2739  ClpXP protease specificity-enhancing factor  59.88 
 
 		 159 aa  191  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0418  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.6 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3540  ClpXP protease specificity-enhancing factor  56 
 
 		 169 aa  184  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.190354  normal  0.0891932 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0363  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.6 
 
 		 173 aa  183  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143816  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0372  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.02 
 
 		 173 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.785538 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2973  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.76 
 
 		 170 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2662  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.02 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.467258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0445  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.02 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3671  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.76 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3646  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.76 
 
 		 173 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3703  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.76 
 
 		 173 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.96 
 
 		 173 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0127228  hitchhiker  0.00000353694 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2694  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.76 
 
 		 175 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.843962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0348  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.87 
 
 		 173 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3260  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.76 
 
 		 173 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1809  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.76 
 
 		 173 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2744  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.76 
 
 		 173 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3543  ClpXP protease specificity-enhancing factor  74.76 
 
 		 175 aa  175  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0934  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.84 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3692  stringent starvation protein B  52.6 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0717  ClpXP protease specificity-enhancing factor  59.44 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5499  stringent starvation protein B  51.7 
 
 		 176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1204  Stringent starvation protein B  56.93 
 
 		 197 aa  163  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0825  ClpXP protease specificity-enhancing factor  66.98 
 
 		 185 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2968  ClpXP protease specificity-enhancing factor  55.4 
 
 		 175 aa  157  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.816462  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0853  ClpXP protease specificity-enhancing factor  69.07 
 
 		 178 aa  157  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0756  Stringent starvation protein B  48.3 
 
 		 175 aa  157  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0793  stringent starvation protein B  48.3 
 
 		 178 aa  157  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24426  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0129  stringent starvation protein B  58.14 
 
 		 135 aa  157  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04048  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0139  Stringent starvation protein B  65.66 
 
 		 135 aa  151  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.253376  normal  0.0968579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3931  stringent starvation protein B  67.01 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1829  ClpXP protease specificity-enhancing factor  55.28 
 
 		 132 aa  144  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1001  ClpXP protease specificity-enhancing factor  59.22 
 
 		 142 aa  140  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1406  ClpXP protease specificity-enhancing factor  59 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0813  ClpXP protease specificity-enhancing factor  60.61 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284281  hitchhiker  0.000260876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0264  stringent starvation protein B  51.89 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119829  hitchhiker  0.00532421 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2204  stringent starvation protein B  41.67 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537889  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03199  stringent starvation protein B  41.72 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000635662  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0463  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.23 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845722  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0527  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.23 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.261361  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1131  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.12 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000374711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3159  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.12 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3303  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.67 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2105  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.054144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13100  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.41 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2629  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.92 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3697  stringent starvation protein B  42.33 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.449226  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2207  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.06 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0753  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.5 
 
 		 138 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.749535  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0302  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.24 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0800734  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2756  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.51 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1958  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.63 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.188367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0907  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.65 
 
 		 137 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004505  stringent starvation protein B  36.2 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000252533  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3197  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.03 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1941  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.49 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1876  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.49 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0295  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.65 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0748969  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4117  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2215  Stringent starvation protein B  50.49 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.143233 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0606  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.1 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000126975  normal  0.116605 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.1 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.288679  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0605  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.1 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444219  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.67 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.214233  normal  0.191438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1587  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3272  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.19 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1365  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.92 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2658  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.5 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0612  ClpXP protease specificity-enhancing factor  36.99 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0755  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.63 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0556951  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3017  ClpXP protease specificity-enhancing factor  36.59 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0478052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0566  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.12 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000750893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3702  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.12 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00424013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4999  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.71 
 
 		 137 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3759  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.12 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3885  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.12 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0903466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4423  stringent starvation protein B  47 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4688  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47 
 
 		 137 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170007  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4162  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.23 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0156887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0255  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.98 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.262631  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1938  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.98 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552634  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2466  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.48 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1321  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.63 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57520  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.53 
 
 		 135 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4403  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.63 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0792  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.98 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.198285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00887  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.92 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0928  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00437  ClpXP protease specificity-enhancing factor  50.5 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0295  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.92 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3663  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47.06 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.163839  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3532  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.27 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4346  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.94 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00332207  hitchhiker  0.00737983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4528  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46 
 
 		 143 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0574  ClpXP protease specificity-enhancing factor  36.96 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.07602  normal  0.363086 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>