More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2741 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  100 
 
 		 390 aa  765    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  78.72 
 
 		 388 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  76.09 
 
 		 390 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  68.21 
 
 		 390 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  68.3 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  66.92 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  64.25 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  53.42 
 
 		 387 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  50.79 
 
 		 405 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  50.38 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  50.38 
 
 		 392 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  48.83 
 
 		 388 aa  332  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  51.56 
 
 		 390 aa  326  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  51.7 
 
 		 391 aa  325  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  50.27 
 
 		 402 aa  325  8.000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  49.74 
 
 		 386 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  49.61 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  53.65 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  51.2 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  52.49 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  48.85 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  49.47 
 
 		 393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  45.1 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  50.39 
 
 		 389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  49.34 
 
 		 390 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  48.06 
 
 		 377 aa  289  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  48.66 
 
 		 383 aa  288  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 368 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  49.18 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  41.76 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  45.83 
 
 		 385 aa  275  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  44.53 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  41.38 
 
 		 401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  41.89 
 
 		 379 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  40.05 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  41.53 
 
 		 401 aa  266  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  41.93 
 
 		 398 aa  266  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  41.33 
 
 		 397 aa  266  7e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  45.12 
 
 		 1139 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  39.63 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  41.42 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  45.84 
 
 		 1143 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  45.57 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  43.01 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  43.85 
 
 		 382 aa  262  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  46.97 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3963  cysteine desulfurase  46.35 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0421265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  38.9 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  46.37 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 533 aa  258  2e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 383 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  38.52 
 
 		 384 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  36.44 
 
 		 492 aa  256  6e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  43.87 
 
 		 402 aa  255  8e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  46.7 
 
 		 381 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  43.48 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  39.79 
 
 		 400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  40 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  38.06 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  36.41 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.53 
 
 		 382 aa  253  6e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  42.2 
 
 		 383 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.52 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.02 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2365  aminotransferase, class V  47.97 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.494188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  45.87 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  38.71 
 
 		 402 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  42.2 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0442  putative aminotransferase  51.08 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0429876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  43.82 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2363  cysteine desulfurase  48.39 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  36.46 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8687  Cysteine desulfurase  45.93 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1241  aminotransferase, class V  47.31 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  46.11 
 
 		 373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  38.79 
 
 		 394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1098  aminotransferase class V  49.46 
 
 		 379 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  45.99 
 
 		 407 aa  245  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  42.9 
 
 		 422 aa  245  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2095  cysteine desulfurase  50.54 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00656129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  39.95 
 
 		 396 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  37.89 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  36.84 
 
 		 414 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.11 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  38.44 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0617  aminotransferase class V  46.51 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.314376  normal  0.0656763 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  45.19 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  44.01 
 
 		 418 aa  243  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  42.82 
 
 		 399 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  36.15 
 
 		 373 aa  242  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  40 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  43.19 
 
 		 1135 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  39.22 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  37.17 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  43.23 
 
 		 385 aa  240  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  40.27 
 
 		 390 aa  239  8e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2206  Cysteine desulfurase  44.82 
 
 		 387 aa  238  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0240111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  40.93 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>