275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2454 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  88.46 
 
 		 104 aa  190  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  85.58 
 
 		 104 aa  186  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  82.69 
 
 		 106 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  79.61 
 
 		 103 aa  176  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.68 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.5 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  46.6 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  48.11 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  48.11 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  48.04 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  48.04 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  44.66 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  47.47 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  44.44 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  39.8 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  41.76 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  48.48 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  48.33 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  36.76 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0027  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.669383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  43.48 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  38.89 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>