More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2609 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  85.11 
 
 
191 aa  310  9e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2992  methyltransferase  71.88 
 
 
192 aa  279  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.094334  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  52.46 
 
 
191 aa  204  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  47.85 
 
 
189 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  40 
 
 
210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  41.18 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0189  methyltransferase, putative  38.33 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0820199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  41.85 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_177  methyltransferase  38.8 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000132935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  38.92 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0164  putative methyltransferase  38.25 
 
 
192 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0357568  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  42.11 
 
 
189 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  37.57 
 
 
188 aa  121  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  37.16 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  39.78 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  40.76 
 
 
178 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  37.02 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  37.02 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  37.02 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  37.02 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  37.02 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  37.02 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  37.02 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  37.02 
 
 
184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  36.17 
 
 
198 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  37.02 
 
 
188 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  45.97 
 
 
187 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  39.27 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  37.02 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  34.07 
 
 
186 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  36.07 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  36.46 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  38.29 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  36.9 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  42.22 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  37.7 
 
 
185 aa  111  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  37.7 
 
 
185 aa  111  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  35.56 
 
 
184 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  36.87 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  40.56 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  36.56 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  37.1 
 
 
193 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.91 
 
 
194 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  33.87 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  34.78 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  36.09 
 
 
180 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  36.09 
 
 
180 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  37.5 
 
 
191 aa  108  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  37.34 
 
 
180 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  37.65 
 
 
183 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  36.11 
 
 
193 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  39.78 
 
 
189 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  39.88 
 
 
183 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  37.08 
 
 
189 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  34.62 
 
 
179 aa  106  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  41.61 
 
 
182 aa  105  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  34.55 
 
 
207 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  37.43 
 
 
212 aa  104  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  38.51 
 
 
190 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  32 
 
 
183 aa  103  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  39.35 
 
 
186 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  36.21 
 
 
184 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  39.55 
 
 
204 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  36.67 
 
 
187 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  37.29 
 
 
192 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  36.26 
 
 
179 aa  102  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  37.99 
 
 
188 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1260  N6-adenine-specific methylase  38.82 
 
 
186 aa  102  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  35.91 
 
 
184 aa  101  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  37.8 
 
 
191 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  46.51 
 
 
201 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  35.83 
 
 
187 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  30.94 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  35.83 
 
 
187 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  35.45 
 
 
185 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  33.14 
 
 
185 aa  99.8  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  30.65 
 
 
185 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  35.23 
 
 
189 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  30.65 
 
 
185 aa  99.4  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  36.87 
 
 
184 aa  99  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  44.72 
 
 
187 aa  98.6  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  33.52 
 
 
179 aa  98.2  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  44.53 
 
 
192 aa  98.2  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  34.48 
 
 
187 aa  98.2  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  43.29 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  40.51 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  44.96 
 
 
185 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  38.78 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  32.91 
 
 
183 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  39.1 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  31.15 
 
 
185 aa  97.1  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  45.31 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  33.55 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  45.97 
 
 
179 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  38.82 
 
 
187 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  35.56 
 
 
198 aa  95.5  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  34.55 
 
 
185 aa  95.1  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  44.53 
 
 
179 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>