214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1343 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1343  peptidase M23B  100 
 
 
271 aa  545  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4760  peptidase M23B  58.38 
 
 
295 aa  218  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0227  peptidase M23B  43.32 
 
 
256 aa  155  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0890169  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0199  peptidase M23B  47.67 
 
 
246 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2350  hypothetical protein  44.51 
 
 
291 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1186  Peptidase M23  40.31 
 
 
274 aa  125  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247646  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  35 
 
 
183 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  40 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  41.58 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  39.84 
 
 
194 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  42.71 
 
 
204 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  31.78 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  33.6 
 
 
446 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  34.96 
 
 
377 aa  62.8  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  30.3 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  32.58 
 
 
198 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  34.17 
 
 
238 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  41 
 
 
196 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  31.58 
 
 
464 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  35.21 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  35.78 
 
 
454 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  26.67 
 
 
327 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  26.67 
 
 
327 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5110  M24/M37 family peptidase  25.81 
 
 
327 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4797  peptidase M23B  26.34 
 
 
327 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0231137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5117  peptidase, M23/M37 family  26.11 
 
 
327 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  30.35 
 
 
503 aa  55.8  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4841  M24/M37 family peptidase  26.11 
 
 
333 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.024057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4683  M24/M37 family peptidase  26.11 
 
 
333 aa  55.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5115  peptidase, M23/M37 family  26.11 
 
 
327 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000714252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5206  M23/37 family peptidase  26.11 
 
 
327 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5077  peptidase, M23/M37 family  26.11 
 
 
327 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  32.21 
 
 
457 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  32.21 
 
 
457 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  27.61 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  28.46 
 
 
695 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  33.57 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  38.68 
 
 
421 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  40.32 
 
 
390 aa  53.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  38.68 
 
 
412 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  38.68 
 
 
421 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  38.68 
 
 
400 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  28.46 
 
 
680 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  29.23 
 
 
690 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  37 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  33.33 
 
 
741 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  35.78 
 
 
457 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  36.89 
 
 
499 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  37.74 
 
 
420 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  37.96 
 
 
523 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  29.41 
 
 
309 aa  52.4  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  35.59 
 
 
255 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  32.29 
 
 
687 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  30.81 
 
 
199 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  32.65 
 
 
448 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  35 
 
 
362 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  28.46 
 
 
676 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  32.79 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  26.92 
 
 
681 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  37.5 
 
 
425 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  31.68 
 
 
473 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  33.33 
 
 
428 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  34.29 
 
 
490 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  37.74 
 
 
425 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  31.4 
 
 
174 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  31.68 
 
 
475 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  25.64 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  36.89 
 
 
512 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  28.23 
 
 
223 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  31.68 
 
 
473 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  32.79 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  36.89 
 
 
472 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  36.89 
 
 
471 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  32.46 
 
 
491 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  28.46 
 
 
692 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  33.66 
 
 
479 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3569  peptidase M23B  29.85 
 
 
328 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  31.48 
 
 
389 aa  50.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  27.21 
 
 
577 aa  49.7  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  38.03 
 
 
569 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0031  M24/M37 family peptidase  32.79 
 
 
299 aa  49.3  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.35 
 
 
441 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  35.4 
 
 
423 aa  49.3  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  31.68 
 
 
472 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  32.67 
 
 
447 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  34.26 
 
 
290 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  29.41 
 
 
352 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1743  Peptidase M23  31.3 
 
 
646 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  32.67 
 
 
468 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  50 
 
 
695 aa  48.9  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  42.31 
 
 
353 aa  48.9  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  31.45 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  31.86 
 
 
651 aa  48.9  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  31.86 
 
 
651 aa  48.9  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  36.89 
 
 
509 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  34.86 
 
 
450 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  33 
 
 
665 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0403  peptidase M23B  40.98 
 
 
170 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00242182  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  36.89 
 
 
470 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  35.14 
 
 
460 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>