More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1127 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0813  AMP-dependent synthetase and ligase  72.71 
 
 
449 aa  669    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3967  AMP-dependent synthetase and ligase  91.28 
 
 
447 aa  841    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.923272  normal  0.0394514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1127  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
447 aa  913    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4047  AMP-dependent synthetase and ligase  52.47 
 
 
447 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3063  AMP-dependent synthetase and ligase  43.85 
 
 
446 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214783  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3791  AMP-dependent synthetase and ligase  42.73 
 
 
446 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.636512 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1426  AMP-dependent synthetase and ligase  38.19 
 
 
449 aa  318  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.745476  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3895  hypothetical protein  43.05 
 
 
446 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1373  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 
496 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.31 
 
 
478 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  26.85 
 
 
518 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  26.04 
 
 
525 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 
516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 
520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  26.58 
 
 
505 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  26.35 
 
 
495 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 
501 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.39 
 
 
514 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 
520 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3072  hypothetical protein  29.28 
 
 
448 aa  124  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6726  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 
473 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149024  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.27 
 
 
526 aa  123  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 
508 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.46 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.05 
 
 
525 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 
662 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 
517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0707  putative AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 
536 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.706357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 
508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 
502 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.61 
 
 
506 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.61 
 
 
506 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 
502 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.61 
 
 
506 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.03 
 
 
483 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.03 
 
 
483 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6525  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 
487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  27.23 
 
 
502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 
508 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 
862 aa  119  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.21 
 
 
490 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 
502 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 
519 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 
518 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 
510 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0163  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.63 
 
 
515 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  25.93 
 
 
546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  26.91 
 
 
514 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.35 
 
 
519 aa  117  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  25.1 
 
 
518 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  25.31 
 
 
515 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4030  feruloyl-CoA synthetase  26.63 
 
 
515 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2967  feruloyl-CoA synthetase  26.63 
 
 
515 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1574  feruloyl-CoA synthetase  26.63 
 
 
515 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3956  feruloyl-CoA synthetase  26.63 
 
 
515 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3343  feruloyl-CoA synthetase  26.63 
 
 
515 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3028  feruloyl-CoA synthetase  26.63 
 
 
515 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 
510 aa  116  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  26.52 
 
 
564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 
555 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  26.83 
 
 
493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  26.6 
 
 
511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25 
 
 
512 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  27.11 
 
 
518 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  27.45 
 
 
511 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  25.88 
 
 
498 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 
533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 
526 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1674  AMP-dependent synthetase and ligase  26.87 
 
 
482 aa  113  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0995  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 
460 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  25.42 
 
 
508 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5076  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 
459 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  25.56 
 
 
553 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 
517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 
491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0961293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  25.62 
 
 
518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  26.51 
 
 
520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  24.79 
 
 
518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.05 
 
 
519 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 
500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  24.69 
 
 
518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 
551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1098  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  25.8 
 
 
506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.54 
 
 
529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 
490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.22 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  26.05 
 
 
522 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  25.36 
 
 
503 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 
530 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  25.77 
 
 
512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 
499 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  28.13 
 
 
564 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  26.37 
 
 
502 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  25.47 
 
 
525 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  25.88 
 
 
585 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  27.12 
 
 
508 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>