More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0780 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 711 aa  1442    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  88.33 
 
 		 710 aa  1268    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1120  glycosyl transferase group 1  53.46 
 
 		 386 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  48.42 
 
 		 293 aa  274  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0966  glycosyl transferase group 1  39.74 
 
 		 382 aa  250  7e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0155699  normal  0.836168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1772  group 1 glycosyl transferase  34.21 
 
 		 392 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2374  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 373 aa  157  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 385 aa  104  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 		 396 aa  97.8  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 367 aa  93.6  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 		 389 aa  92.4  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 393 aa  91.3  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 391 aa  90.9  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 419 aa  90.1  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 395 aa  89  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  30.05 
 
 		 935 aa  88.6  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  27.41 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26.8 
 
 		 650 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  35.47 
 
 		 415 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 364 aa  80.5  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  29.86 
 
 		 638 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  35.12 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  41.38 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.25 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.25 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.25 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.9 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  27.11 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  22.67 
 
 		 392 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  23.95 
 
 		 346 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 		 391 aa  77  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 384 aa  77  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1055  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 372 aa  77  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 422 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  28.85 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 261 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 241 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 255 aa  76.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  39.17 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  31.77 
 
 		 241 aa  75.5  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.11 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  33.2 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.46 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 672 aa  74.3  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  38.71 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 		 371 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 370 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  32.46 
 
 		 415 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 		 405 aa  73.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 222 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 		 398 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  26.99 
 
 		 442 aa  73.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  34.48 
 
 		 273 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 376 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  40.87 
 
 		 244 aa  73.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  33.1 
 
 		 168 aa  72.4  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 237 aa  72  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 446 aa  72  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1589  glycosyltransferase  22.39 
 
 		 393 aa  72  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.679679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  40 
 
 		 249 aa  72.4  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2760  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 		 1039 aa  72  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 430 aa  72  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>