142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1744 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  100 
 
 		 421 aa  837    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  48.88 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  49.75 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  45.23 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  46.15 
 
 		 397 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  47.04 
 
 		 406 aa  346  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  45.36 
 
 		 412 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  46.39 
 
 		 405 aa  342  8e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  44.83 
 
 		 414 aa  341  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  43.6 
 
 		 414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  46.97 
 
 		 402 aa  335  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  44.12 
 
 		 410 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  43.32 
 
 		 404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  41.16 
 
 		 396 aa  295  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  40.38 
 
 		 425 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  40.38 
 
 		 425 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  40.38 
 
 		 425 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  40.38 
 
 		 425 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  40.38 
 
 		 425 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  40.38 
 
 		 425 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  40.38 
 
 		 425 aa  273  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  40.14 
 
 		 425 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  40 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  40 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  40 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  40 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  40 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  40 
 
 		 425 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  41.45 
 
 		 425 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  42.74 
 
 		 425 aa  269  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  34.35 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  33.26 
 
 		 418 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  33.1 
 
 		 414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  33.02 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  33.02 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  33.02 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  33.18 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  33.33 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0464551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  32.08 
 
 		 422 aa  210  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  31.78 
 
 		 419 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  31.37 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  31.37 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  31.53 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  31.53 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  31.53 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  31.53 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  31.53 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0641678 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  31.53 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  31.53 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  31.53 
 
 		 418 aa  199  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  32.56 
 
 		 458 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  31.29 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  28.87 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  35.1 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  32.87 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  30.07 
 
 		 418 aa  156  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  29.95 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  30.62 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  30.62 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  30.62 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  30.62 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  30.62 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  32.8 
 
 		 416 aa  143  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 387 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  25.67 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  23.31 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.33 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.75 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  23.91 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  25.42 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  25.42 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  25.42 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.42 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.42 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.42 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.42 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.77 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  24.01 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.77 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.77 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.85 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.5 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>