268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6461 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  74.13 
 
 		 450 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  97.16 
 
 		 437 aa  850    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  100 
 
 		 437 aa  895    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  77.73 
 
 		 432 aa  687    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  68.6 
 
 		 430 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  68 
 
 		 438 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  68.87 
 
 		 431 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  71.03 
 
 		 430 aa  600  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  71.03 
 
 		 430 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  66.51 
 
 		 434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  68.03 
 
 		 442 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  65 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  65 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  59.95 
 
 		 475 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  64.05 
 
 		 442 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  62.5 
 
 		 443 aa  528  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  60.93 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2596  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  50.38 
 
 		 457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3521  bicarbonate transport system substrate-binding protein  50.38 
 
 		 457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4925  bicarbonate transport system substrate-binding protein  49.88 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.794472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1027  bicarbonate transport system substrate-binding protein  49.52 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4678  ABC-type bicarbonate transport system substrate-binding protein  47.37 
 
 		 452 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1488  membrane protein  46.29 
 
 		 450 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.976236 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  37 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  43.14 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  40.74 
 
 		 417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  39.72 
 
 		 433 aa  302  9e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  40.05 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  42.15 
 
 		 415 aa  299  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  40.19 
 
 		 419 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  41.22 
 
 		 418 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  40.38 
 
 		 419 aa  293  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  41.41 
 
 		 434 aa  292  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  39.58 
 
 		 414 aa  292  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  39.5 
 
 		 419 aa  292  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  39.34 
 
 		 414 aa  292  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  40.66 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  37.03 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  39.53 
 
 		 414 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  41.55 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  41.55 
 
 		 426 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  40.92 
 
 		 426 aa  289  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  41.04 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  38.89 
 
 		 414 aa  288  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  40.05 
 
 		 427 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  39.63 
 
 		 414 aa  285  9e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  39.63 
 
 		 414 aa  285  9e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  40.24 
 
 		 417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  39.62 
 
 		 431 aa  283  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  38.55 
 
 		 414 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  38.57 
 
 		 407 aa  280  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  40.51 
 
 		 414 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  40.56 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.43 
 
 		 669 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  37.91 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  37.41 
 
 		 440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  36.02 
 
 		 403 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  36.27 
 
 		 403 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.16 
 
 		 668 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.93 
 
 		 669 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.93 
 
 		 669 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  35.32 
 
 		 657 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.92 
 
 		 673 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.75 
 
 		 668 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.75 
 
 		 668 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  34.84 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.62 
 
 		 404 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  33.65 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  35.37 
 
 		 404 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  36.04 
 
 		 400 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  33.08 
 
 		 663 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.41 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.28 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  35.53 
 
 		 402 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.17 
 
 		 668 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.69 
 
 		 385 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  34.4 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  32.91 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  34.59 
 
 		 667 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  33.12 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  32.55 
 
 		 466 aa  223  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.42 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  33.33 
 
 		 403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  31.22 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  33.41 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  34.26 
 
 		 467 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  32.76 
 
 		 415 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  32.93 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  31.85 
 
 		 462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  32.08 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  31.49 
 
 		 469 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  33.55 
 
 		 455 aa  212  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  31.9 
 
 		 469 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  35.85 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  31.92 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  31.7 
 
 		 491 aa  211  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  32.63 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  32.56 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  32.68 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>