131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4197 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
288 aa  594  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  91.96 
 
 
288 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  60.84 
 
 
286 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.12 
 
 
287 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.98 
 
 
287 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2113  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.69 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0578211  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
301 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2766  hypothetical protein  32.58 
 
 
281 aa  109  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3303  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.92 
 
 
291 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2656  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.92 
 
 
291 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2093  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.39 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1289  hypothetical protein  28.89 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  0.614576 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0964  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.29 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1208  hypothetical protein  29.8 
 
 
289 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.19 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1729  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.35 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102373  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.69 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1756  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 
286 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6261  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.87 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.87 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.63 
 
 
278 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.79 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5302  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.09 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.07 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.92 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1144  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.18 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2228  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.96 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2351  hypothetical protein  30.88 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286388  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1052  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.85 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00191941  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350.1  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.62 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0665906  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2361  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.52 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0055  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.52 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.52 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1114  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.52 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1455  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.96 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271612  normal  0.540274 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2196  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.19 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.19 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.64 
 
 
591 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.87 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  30.66 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.02 
 
 
639 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  27.02 
 
 
639 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.99 
 
 
837 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.71 
 
 
808 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  29.25 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.8 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.8 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.9 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.82 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.8 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.8 
 
 
242 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.39 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.65 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  28.84 
 
 
657 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.49 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.26 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.65 
 
 
269 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.74 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 
644 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.03 
 
 
283 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.46 
 
 
312 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.83 
 
 
634 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.19 
 
 
242 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.78 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  23.61 
 
 
617 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.02 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.13 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  31.21 
 
 
254 aa  53.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.62 
 
 
266 aa  52.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.26 
 
 
257 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.15 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.65 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.12 
 
 
279 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.81 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.91 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.96 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.19 
 
 
245 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.68 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.72 
 
 
231 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.8 
 
 
338 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  35.8 
 
 
338 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.4 
 
 
1153 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.03 
 
 
288 aa  48.9  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.51 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.95 
 
 
250 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.57 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.5 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.5 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.54 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.26 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.54 
 
 
328 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.72 
 
 
226 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.07 
 
 
255 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  32.38 
 
 
673 aa  46.2  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0040  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.79 
 
 
329 aa  46.2  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>