More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3567 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  91.94 
 
 		 360 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 360 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  67.6 
 
 		 540 aa  448  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2666  Sel1 domain-containing protein  66.88 
 
 		 381 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0163222  normal  0.379262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  45.58 
 
 		 337 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  43.44 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  47.59 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  47.59 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  36.09 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.59 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  35.43 
 
 		 368 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  35.16 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  32.44 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  37.89 
 
 		 384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  38.58 
 
 		 372 aa  146  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.9 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.95 
 
 		 347 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.65 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  33.21 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  32.97 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  40.47 
 
 		 684 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  34.66 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  34.31 
 
 		 350 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.3 
 
 		 319 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  35.13 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  34.68 
 
 		 789 aa  125  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0156  hypothetical protein  34.5 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  33.77 
 
 		 961 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.49 
 
 		 1037 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.22 
 
 		 557 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.04 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.52 
 
 		 831 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 1032 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.6 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  30.34 
 
 		 685 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.51 
 
 		 1402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.48 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  32.59 
 
 		 489 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.05 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32.91 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  34.08 
 
 		 1493 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  32.24 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.59 
 
 		 490 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.19 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.59 
 
 		 490 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  35.05 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 		 976 aa  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  35.45 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.32 
 
 		 838 aa  100  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 		 1430 aa  99.8  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.73 
 
 		 528 aa  99.4  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.83 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.7 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.3 
 
 		 256 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.69 
 
 		 593 aa  97.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  28.74 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.5 
 
 		 255 aa  97.1  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.5 
 
 		 2413 aa  95.9  9e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.85 
 
 		 235 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  30.67 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1877 aa  94.7  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  30.7 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  32.91 
 
 		 380 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  31.86 
 
 		 961 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  29.73 
 
 		 342 aa  93.6  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.1 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  30.23 
 
 		 839 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.24 
 
 		 865 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1002 aa  91.3  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.54 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.08 
 
 		 270 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  31.09 
 
 		 380 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  30.8 
 
 		 246 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28.97 
 
 		 271 aa  89.4  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  33.52 
 
 		 232 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  30.84 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  34.23 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  29.91 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.62 
 
 		 264 aa  87.4  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  29.91 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  32.38 
 
 		 464 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.03 
 
 		 254 aa  86.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  30.7 
 
 		 245 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.13 
 
 		 267 aa  86.7  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  27.81 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  30.52 
 
 		 680 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.86 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  32.29 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  25.44 
 
 		 523 aa  80.1  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  28.94 
 
 		 552 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.8 
 
 		 890 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.22 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.64 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  26.64 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.5 
 
 		 731 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  28.45 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.51 
 
 		 811 aa  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  35.17 
 
 		 850 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>