More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2870 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 211 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  96.68 
 
 		 211 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  63.51 
 
 		 210 aa  251  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  58.29 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  59.42 
 
 		 206 aa  224  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.87 
 
 		 204 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  52.61 
 
 		 208 aa  191  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  50.24 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  46.5 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.76 
 
 		 207 aa  171  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.5 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  52.56 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5434  lysine exporter protein LysE/YggA  49.55 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  51.34 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  53.25 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  38.94 
 
 		 204 aa  158  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  52.66 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  52.66 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  52.66 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  52.66 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  52.66 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.76 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  44.02 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.36 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0231  putative (homoserine/homoserine lactone) efflux transmembrane protein  48.6 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3883  LysE family translocator protein  52.07 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  40.48 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  37.91 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  33.33 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0202  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.79 
 
 		 159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  39.59 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  34.6 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.12 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  38.27 
 
 		 203 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.06 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  37 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.71 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  37.24 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  34.27 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.12 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.41 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.26 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.71 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.32 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.49 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1710  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  33.8 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35 
 
 		 205 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 		 206 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.41 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.54 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.41 
 
 		 206 aa  111  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.62 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.41 
 
 		 206 aa  111  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.69 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.41 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  32.5 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2910  hypothetical protein  36.32 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  35.1 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.13 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.68 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  33.49 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  34.93 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  34.93 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.93 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.93 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  34.93 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.93 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.93 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  32.29 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2082  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  32.97 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  32.29 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.01 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  34.16 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.1 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  37.22 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>