54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2910 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2910  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.2 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.2 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  27.83 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  28.84 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  28.99 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  27.04 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  23.44 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.81 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  28.97 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  26.04 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  26.96 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  23.83 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.13 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  28.92 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  25.55 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  28.31 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  22.6 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.1 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  22.6 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.89 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  24.88 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  25.69 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  26.09 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  24.18 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  25.12 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  27.88 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.89 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  22.8 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.17 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.68 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  23.72 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  27.88 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  28.87 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.46 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  21.63 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  27.44 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  30.21 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2130  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.6 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  27.27 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  27.27 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  27.27 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.45 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  25.38 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.74 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.81 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  27.27 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.45 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.11 
 
 		 209 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.45 
 
 		 206 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.45 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  22.22 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.45 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>