More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2108 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  94.59 
 
 		 388 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  100 
 
 		 405 aa  802    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  65.1 
 
 		 387 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  67.89 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  55.97 
 
 		 386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  54.5 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  54.5 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  54.64 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  44.16 
 
 		 382 aa  343  2e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  50.4 
 
 		 390 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  50.79 
 
 		 390 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  50.8 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  51.18 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  51.57 
 
 		 399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  51.32 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  51.05 
 
 		 390 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  46.86 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  44.33 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  43.27 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  45.09 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  43.83 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  46.97 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  45.5 
 
 		 392 aa  266  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  44.87 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  45.12 
 
 		 389 aa  259  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  43.01 
 
 		 390 aa  254  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  41.8 
 
 		 387 aa  254  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  36.75 
 
 		 401 aa  253  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  36.57 
 
 		 401 aa  252  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  37 
 
 		 398 aa  252  7e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  42.19 
 
 		 385 aa  249  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  46.3 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  36.55 
 
 		 398 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  36.32 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  35.43 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  40.46 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  38.92 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  39.69 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  36.92 
 
 		 392 aa  239  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  36.48 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  39.38 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  34.53 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  38.56 
 
 		 394 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  41.22 
 
 		 1143 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  42.67 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  38.78 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  42.56 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  42.93 
 
 		 381 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  35.14 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 533 aa  229  9e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  39.64 
 
 		 382 aa  229  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  38.7 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  32.22 
 
 		 492 aa  227  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  40.41 
 
 		 408 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  35.05 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  40.1 
 
 		 1135 aa  227  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  34.67 
 
 		 402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  42.97 
 
 		 373 aa  226  7e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  39.59 
 
 		 385 aa  225  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  35.32 
 
 		 396 aa  225  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  39.39 
 
 		 393 aa  225  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  34.55 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  37.37 
 
 		 388 aa  223  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8687  Cysteine desulfurase  41.45 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  39.38 
 
 		 384 aa  222  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2206  Cysteine desulfurase  42.6 
 
 		 387 aa  222  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0240111  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  42.67 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0617  aminotransferase class V  43.19 
 
 		 388 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.314376  normal  0.0656763 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  34.77 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  34.94 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  39.3 
 
 		 1139 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  37.03 
 
 		 402 aa  219  7e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  36.99 
 
 		 407 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  37.79 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  36.41 
 
 		 399 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  38.34 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  35.23 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  34.46 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.44 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  37.6 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  36.93 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  33.07 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  37.84 
 
 		 391 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  34.9 
 
 		 389 aa  217  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  35.64 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  38.79 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  38.68 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  40.41 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  36.36 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  38.6 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  35.06 
 
 		 394 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  38.38 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  33.25 
 
 		 414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  36.84 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  35.05 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  36.84 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  36.84 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  34.02 
 
 		 381 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  37.63 
 
 		 400 aa  212  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>