231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1025 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 327 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  71.34 
 
 		 329 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  66.87 
 
 		 325 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  63.38 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  61.61 
 
 		 328 aa  404  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  62.9 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  60.5 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  61.13 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  60.37 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  61.49 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  59.75 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  57.32 
 
 		 329 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  57.86 
 
 		 328 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  57.86 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  57.55 
 
 		 325 aa  368  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  57.86 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  57.06 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  57.06 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  57.06 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  57.55 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  57.86 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  56.05 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  56.29 
 
 		 354 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  59.94 
 
 		 347 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  55.52 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  59.69 
 
 		 346 aa  362  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  57.94 
 
 		 344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  57.93 
 
 		 353 aa  360  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  57.76 
 
 		 354 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  58.62 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  57.19 
 
 		 341 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  57.19 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  56.63 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4372  integral membrane protein TerC  57.19 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  56.8 
 
 		 334 aa  348  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  55.86 
 
 		 329 aa  345  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33470  Integral membrane protein TerC family  58.62 
 
 		 324 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4912  Integral membrane protein TerC  56.1 
 
 		 341 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  49.35 
 
 		 337 aa  305  6e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  47.91 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  47.54 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  47.77 
 
 		 329 aa  296  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  47.66 
 
 		 320 aa  289  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  47.6 
 
 		 325 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  47.23 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  48.75 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  46.38 
 
 		 314 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  45.96 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  46.63 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  48.6 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  48.39 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  47.9 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  46.18 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  44.19 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  47.06 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  45.86 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  44.16 
 
 		 318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  43.55 
 
 		 321 aa  268  8e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  44.22 
 
 		 308 aa  265  5e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  48.39 
 
 		 317 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  43.35 
 
 		 317 aa  265  7e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  45.62 
 
 		 317 aa  265  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  48.39 
 
 		 317 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  44.62 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  43.67 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  45.69 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  44.41 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  44.41 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  44.41 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  45.37 
 
 		 322 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  46.45 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  45.65 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  45.37 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  45.37 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  45.37 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  43.71 
 
 		 321 aa  252  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  46.44 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  45.45 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  45.13 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  44.1 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  45.13 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  45.13 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  45.13 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  45.13 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  45.13 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  45.13 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  46.3 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  45.13 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  42.41 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  45.6 
 
 		 344 aa  245  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  40.88 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  38.82 
 
 		 322 aa  245  6.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  44.65 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  46.15 
 
 		 320 aa  242  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  45.77 
 
 		 327 aa  241  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  42.63 
 
 		 322 aa  241  9e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  46.25 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  44.44 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  45.65 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  42.81 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>