103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5814 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
459 aa  922    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  88.67 
 
 
459 aa  828    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  60.31 
 
 
453 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  63.21 
 
 
468 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  55.41 
 
 
463 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  51.77 
 
 
461 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  49.67 
 
 
456 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  40.25 
 
 
475 aa  266  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  41.36 
 
 
483 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  34.34 
 
 
493 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  38.82 
 
 
515 aa  218  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  33.25 
 
 
482 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  28.15 
 
 
467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  28.51 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  28.38 
 
 
453 aa  136  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  28.7 
 
 
460 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  28.01 
 
 
474 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  27.44 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  28.72 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  24.45 
 
 
485 aa  66.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  25.64 
 
 
472 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  25.64 
 
 
472 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  25.64 
 
 
472 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  25.64 
 
 
472 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  24.15 
 
 
472 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  25.76 
 
 
472 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  24.15 
 
 
472 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  24.15 
 
 
472 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  24.15 
 
 
482 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  24.15 
 
 
472 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  24.15 
 
 
472 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  23.77 
 
 
482 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  24.54 
 
 
505 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  23.77 
 
 
482 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  27.05 
 
 
481 aa  60.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  29.96 
 
 
468 aa  60.1  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  24.5 
 
 
498 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  29.96 
 
 
528 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  24.83 
 
 
498 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  24.83 
 
 
498 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  24.83 
 
 
498 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  24.83 
 
 
498 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  24.17 
 
 
498 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  24.83 
 
 
498 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  24.5 
 
 
498 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  25.27 
 
 
515 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  22.73 
 
 
501 aa  57  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  24.69 
 
 
515 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  24.83 
 
 
493 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  24.5 
 
 
498 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  27.82 
 
 
472 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  23.84 
 
 
498 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  23.84 
 
 
498 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  23.51 
 
 
498 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  29.03 
 
 
516 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  27.67 
 
 
502 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  28.3 
 
 
508 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  24.06 
 
 
497 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  25.09 
 
 
488 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  26.57 
 
 
464 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  33.63 
 
 
509 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  25.56 
 
 
499 aa  50.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3270  cryptic L-xylulose kinase  24.2 
 
 
498 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  24.2 
 
 
498 aa  50.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  24.2 
 
 
498 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  26.3 
 
 
509 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  24 
 
 
505 aa  49.7  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3504  carbohydrate kinase FGGY  26.02 
 
 
482 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2505  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.49 
 
 
494 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00721444  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  27.27 
 
 
511 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1269  carbohydrate kinase FGGY  26.64 
 
 
512 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.237373  normal  0.4507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  27.27 
 
 
506 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  25.32 
 
 
497 aa  47  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  24.3 
 
 
494 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  28.4 
 
 
495 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  28.82 
 
 
492 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  28.82 
 
 
492 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  28.82 
 
 
492 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.71 
 
 
530 aa  46.6  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  23.79 
 
 
494 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  23.79 
 
 
494 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  24.8 
 
 
502 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  20.75 
 
 
476 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  21.27 
 
 
502 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0307  carbohydrate kinase  31.62 
 
 
641 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2975  carbohydrate kinase FGGY  28.46 
 
 
523 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  27.95 
 
 
492 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  26.04 
 
 
489 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  25 
 
 
509 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  23.56 
 
 
500 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2920  carbohydrate kinase  31.9 
 
 
537 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  25.68 
 
 
517 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  23.3 
 
 
489 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  25.68 
 
 
517 aa  43.9  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  25.68 
 
 
511 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  21.57 
 
 
518 aa  44.3  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  26.95 
 
 
518 aa  44.3  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  24.67 
 
 
502 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1144  xylulose kinase  31.9 
 
 
537 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2764  carbohydrate kinase  31.9 
 
 
537 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>