More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4805 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  100 
 
 		 868 aa  1722    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3322  hypothetical protein  61.96 
 
 		 392 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0572768 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5727  hypothetical protein  59.04 
 
 		 395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0500191  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2419  hypothetical protein  49.62 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.337062 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5853  hypothetical protein  51.01 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6766  hypothetical protein  49.62 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5346  hypothetical protein  53.83 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0355  hypothetical protein  50 
 
 		 389 aa  382  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3552  hypothetical protein  45.33 
 
 		 383 aa  322  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3321  MATE efflux family protein  47.63 
 
 		 489 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  36.7 
 
 		 394 aa  259  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1501  cystathionine gamma-lyase  38.48 
 
 		 379 aa  259  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1550  cystathionine gamma-lyase  38.38 
 
 		 379 aa  259  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  39.76 
 
 		 408 aa  258  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  36.97 
 
 		 392 aa  257  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  35.73 
 
 		 390 aa  243  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  35.37 
 
 		 392 aa  243  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  37.06 
 
 		 392 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  37.77 
 
 		 378 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  37.97 
 
 		 378 aa  238  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  36.78 
 
 		 384 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  37.4 
 
 		 377 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  34.7 
 
 		 393 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  36.94 
 
 		 393 aa  236  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  36.78 
 
 		 384 aa  235  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  35.68 
 
 		 390 aa  234  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  35.75 
 
 		 397 aa  234  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  32.8 
 
 		 413 aa  233  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  35.15 
 
 		 391 aa  232  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  36.46 
 
 		 397 aa  231  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  37.17 
 
 		 380 aa  231  5e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  35.14 
 
 		 397 aa  230  9e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  34.86 
 
 		 397 aa  230  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  35.14 
 
 		 397 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  35.14 
 
 		 397 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  35.73 
 
 		 423 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  36.31 
 
 		 377 aa  229  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  33.96 
 
 		 405 aa  229  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  36.31 
 
 		 377 aa  229  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  36.04 
 
 		 377 aa  229  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0801  cystathionine gamma-synthase  36.59 
 
 		 367 aa  229  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  36.04 
 
 		 377 aa  228  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  34.86 
 
 		 397 aa  228  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  37.34 
 
 		 390 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  34.86 
 
 		 397 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  36.04 
 
 		 377 aa  228  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  35.68 
 
 		 394 aa  228  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  36.76 
 
 		 380 aa  228  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  35.73 
 
 		 423 aa  228  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.13 
 
 		 397 aa  227  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  36.22 
 
 		 392 aa  227  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  36.04 
 
 		 377 aa  227  8e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  37.4 
 
 		 377 aa  227  9e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  37.17 
 
 		 401 aa  226  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  36.04 
 
 		 377 aa  226  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  38.65 
 
 		 391 aa  226  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  36.04 
 
 		 377 aa  226  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  36.04 
 
 		 377 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  36.04 
 
 		 377 aa  226  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1990  cystathionine beta-lyase  37.23 
 
 		 383 aa  226  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.916692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  34.59 
 
 		 397 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  34.13 
 
 		 392 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  32.8 
 
 		 394 aa  225  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  38.5 
 
 		 401 aa  225  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  35.75 
 
 		 379 aa  224  7e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1630  Cystathionine beta-lyase  37.9 
 
 		 386 aa  223  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  36.39 
 
 		 385 aa  223  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  36.02 
 
 		 393 aa  223  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  35.03 
 
 		 376 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1667  cystathionine gamma-synthase  36.14 
 
 		 367 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3333  Cystathionine gamma-synthase  35.23 
 
 		 393 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  35.45 
 
 		 377 aa  222  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  34.57 
 
 		 379 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  35.05 
 
 		 380 aa  222  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  35.05 
 
 		 380 aa  222  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  35.54 
 
 		 384 aa  220  8.999999999999998e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  35.62 
 
 		 392 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  35.97 
 
 		 392 aa  220  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  35.62 
 
 		 392 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  34.4 
 
 		 391 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  33.33 
 
 		 377 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  36.77 
 
 		 390 aa  220  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  35.81 
 
 		 390 aa  220  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  35.62 
 
 		 392 aa  219  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1876  cystathionine gamma-synthase  35.25 
 
 		 341 aa  219  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.562366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  35.62 
 
 		 392 aa  219  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  33.6 
 
 		 386 aa  219  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  35.62 
 
 		 392 aa  219  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.01 
 
 		 397 aa  218  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  35.89 
 
 		 391 aa  218  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  35.89 
 
 		 391 aa  218  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  36.66 
 
 		 386 aa  217  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  32.07 
 
 		 399 aa  217  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.48 
 
 		 396 aa  216  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  34.93 
 
 		 391 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.34 
 
 		 406 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  35.54 
 
 		 378 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1758  cystathionine gamma-lyase  34.49 
 
 		 379 aa  216  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  35.07 
 
 		 392 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  36.27 
 
 		 397 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>