More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4571 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  92.22 
 
 
360 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4571  ABC transporter related  100 
 
 
360 aa  720    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0013207  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.06 
 
 
363 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  59.38 
 
 
357 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1725  ABC transporter related  59.32 
 
 
361 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.897098 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  60.11 
 
 
356 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  58.13 
 
 
363 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  58.31 
 
 
368 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.89 
 
 
359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  56.63 
 
 
365 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  56.42 
 
 
393 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  54.52 
 
 
357 aa  388  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  55.62 
 
 
361 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.03 
 
 
378 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  48.35 
 
 
389 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  51.7 
 
 
357 aa  349  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  49.06 
 
 
376 aa  348  9e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  48.16 
 
 
369 aa  344  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.88 
 
 
369 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  50.56 
 
 
361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.96 
 
 
352 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  48.08 
 
 
386 aa  342  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  50 
 
 
372 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  50 
 
 
372 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  50 
 
 
372 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  50.28 
 
 
356 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.45 
 
 
372 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  47.22 
 
 
369 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  50.14 
 
 
363 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.28 
 
 
363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  47.9 
 
 
355 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.28 
 
 
363 aa  338  7e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  49.72 
 
 
372 aa  338  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  53.99 
 
 
357 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  49.32 
 
 
371 aa  338  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  49.29 
 
 
356 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  53.37 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  49.71 
 
 
364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  49.3 
 
 
353 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  48.9 
 
 
381 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  47.9 
 
 
355 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.56 
 
 
365 aa  335  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  50.7 
 
 
353 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  48.9 
 
 
359 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  50 
 
 
361 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  49.72 
 
 
365 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  49.31 
 
 
357 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  48.24 
 
 
371 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  48.24 
 
 
371 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  47.85 
 
 
381 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  48.61 
 
 
349 aa  331  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  50.14 
 
 
353 aa  331  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  48.9 
 
 
358 aa  331  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  48.49 
 
 
384 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  48.49 
 
 
384 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  48.47 
 
 
353 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  48.01 
 
 
381 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.7 
 
 
349 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  48.88 
 
 
360 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  47.04 
 
 
364 aa  330  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  48.16 
 
 
356 aa  329  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.65 
 
 
356 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.48 
 
 
356 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  47.81 
 
 
353 aa  329  5.0000000000000004e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.27 
 
 
356 aa  329  5.0000000000000004e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  49.29 
 
 
361 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  48.58 
 
 
333 aa  328  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  46.99 
 
 
358 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  48.75 
 
 
357 aa  329  6e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  48.89 
 
 
386 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  48.2 
 
 
371 aa  328  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  48.89 
 
 
361 aa  328  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.16 
 
 
356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  48.73 
 
 
352 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  54.04 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  47.79 
 
 
353 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.16 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  50.14 
 
 
363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  48.32 
 
 
365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  48.07 
 
 
355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  47.4 
 
 
384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.65 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  47.78 
 
 
384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  48.59 
 
 
380 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  49.72 
 
 
357 aa  326  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.61 
 
 
386 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.16 
 
 
356 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  51.95 
 
 
363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 
356 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  48.15 
 
 
351 aa  326  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.76 
 
 
369 aa  325  5e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  48.48 
 
 
357 aa  325  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  46.8 
 
 
355 aa  325  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  47.51 
 
 
364 aa  325  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  46.24 
 
 
364 aa  325  8.000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  49.18 
 
 
359 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  49.44 
 
 
354 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  52.32 
 
 
354 aa  325  9e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  51.57 
 
 
356 aa  325  9e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>