More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0719 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  93.55 
 
 
248 aa  441  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.02 
 
 
248 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.02 
 
 
248 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.61 
 
 
248 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.81 
 
 
262 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.82 
 
 
248 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.6 
 
 
248 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.58 
 
 
248 aa  364  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.42 
 
 
248 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.79 
 
 
248 aa  358  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.4 
 
 
248 aa  354  6.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.19 
 
 
248 aa  351  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.6 
 
 
274 aa  348  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2114  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.81 
 
 
248 aa  348  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.81 
 
 
248 aa  346  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.79 
 
 
248 aa  345  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  68.55 
 
 
248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.26 
 
 
249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.82 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.46 
 
 
271 aa  287  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.85 
 
 
249 aa  286  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 
249 aa  284  7e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
249 aa  280  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.28 
 
 
251 aa  278  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  54.44 
 
 
246 aa  270  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.37 
 
 
249 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.55 
 
 
249 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.73 
 
 
255 aa  266  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.28 
 
 
251 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.72 
 
 
250 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 
251 aa  235  6e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
249 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3542  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 
249 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4242  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  55.47 
 
 
250 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.02 
 
 
249 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.5 
 
 
250 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 
250 aa  220  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 
246 aa  208  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
246 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
247 aa  202  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
261 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.44 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  42.28 
 
 
255 aa  195  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.67 
 
 
269 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
245 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.28 
 
 
247 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.91 
 
 
247 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
246 aa  189  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
285 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
254 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
247 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.9 
 
 
254 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.09 
 
 
247 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
247 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.74 
 
 
250 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.74 
 
 
250 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.82 
 
 
246 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
254 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
254 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  41.63 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.6 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.95 
 
 
251 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  43.6 
 
 
246 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
248 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
248 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
248 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
254 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
243 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12103  predicted protein  42.34 
 
 
273 aa  180  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.932364  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1104  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.8 
 
 
247 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12325  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
247 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0256  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 
247 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0321  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.8 
 
 
247 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1272  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.8 
 
 
247 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.8 
 
 
247 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1687  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.8 
 
 
247 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.06 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
250 aa  179  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1775  dehydrogenases with different specificities  42.86 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.84 
 
 
246 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
255 aa  178  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.65 
 
 
248 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
261 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
243 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
252 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
257 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  42.8 
 
 
247 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
251 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
251 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
251 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
248 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.56 
 
 
250 aa  175  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
245 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>