69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4271 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  711    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  37.12 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  35.94 
 
 		 355 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  33.69 
 
 		 371 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  33.73 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  32.73 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  33.53 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  32.63 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  31.34 
 
 		 355 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.09 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.09 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  27.97 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  34.7 
 
 		 575 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  40 
 
 		 312 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6543  hypothetical protein  25.54 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  27.75 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  39.66 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5573  hypothetical protein  26.39 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  26.8 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  32.41 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  29.76 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  28.07 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  27.8 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  25.79 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  25.47 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  30.41 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  26.95 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  26.94 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  30.18 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  26.33 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  25.38 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  28.51 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  24.91 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  40.82 
 
 		 847 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  27.46 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  28.24 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  30.21 
 
 		 401 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  30.2 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  28.67 
 
 		 345 aa  52.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  29.33 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  30.92 
 
 		 777 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  26.26 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  36.17 
 
 		 776 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  35.77 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  26.28 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  27.8 
 
 		 345 aa  50.8  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  27.1 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  35.48 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  30.3 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  28.4 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0981  hypothetical protein  27.38 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  33.9 
 
 		 678 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  40.91 
 
 		 681 aa  46.6  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  40.91 
 
 		 681 aa  46.6  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0352  hypothetical protein  26.62 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  24.38 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  24.38 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  26.49 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  38.1 
 
 		 777 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  38.1 
 
 		 777 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  38.1 
 
 		 777 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  26.83 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  36.84 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  25.23 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  28.48 
 
 		 777 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  26.32 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  38.1 
 
 		 777 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.71 
 
 		 866 aa  43.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>