More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3523 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3523  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3981  two component transcriptional regulator  81.7 
 
 		 230 aa  340  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1322  two component transcriptional regulator  78.21 
 
 		 239 aa  332  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4138  two component transcriptional regulator  77.35 
 
 		 239 aa  329  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.794435  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.87 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.87 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  46.85 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.62 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 220 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.06 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 247 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 247 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.89 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.89 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.89 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4259  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 220 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  44.8 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 253 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  45.7 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 282 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 242 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 242 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 282 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.91 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.33 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 220 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  46.15 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 220 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.64 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  43.64 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.64 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.64 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.64 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.64 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  43.64 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.34 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.04 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.64 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  42.72 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  42.72 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  42.08 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 222 aa  179  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  40.81 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  42.73 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  40.81 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  39.48 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 220 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>