More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3308 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  67.27 
 
 		 622 aa  814    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  65.15 
 
 		 657 aa  821    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  64.21 
 
 		 635 aa  799    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  62.22 
 
 		 674 aa  800    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  58.58 
 
 		 651 aa  708    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 664 aa  1337    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  70.45 
 
 		 660 aa  882    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  65.45 
 
 		 657 aa  823    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  69.49 
 
 		 644 aa  868    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  62.04 
 
 		 698 aa  799    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  60.15 
 
 		 604 aa  706    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  59.94 
 
 		 687 aa  752    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  49.63 
 
 		 636 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  49.19 
 
 		 635 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  49.34 
 
 		 647 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  47.9 
 
 		 661 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  47.46 
 
 		 661 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  47.77 
 
 		 667 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  47.54 
 
 		 661 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  47.77 
 
 		 667 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  48.84 
 
 		 652 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  48.45 
 
 		 655 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  47.58 
 
 		 681 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  47.9 
 
 		 705 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  47.22 
 
 		 681 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  47.79 
 
 		 662 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  47.23 
 
 		 684 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  47.23 
 
 		 684 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  47.23 
 
 		 684 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  47.23 
 
 		 684 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  47.23 
 
 		 684 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  46.87 
 
 		 691 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  48.05 
 
 		 615 aa  549  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  46.73 
 
 		 616 aa  546  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  48.56 
 
 		 625 aa  537  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  47.02 
 
 		 634 aa  531  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  46.9 
 
 		 613 aa  525  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  46.23 
 
 		 629 aa  515  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  43.61 
 
 		 630 aa  511  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  45.17 
 
 		 623 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  46.67 
 
 		 628 aa  505  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  41.96 
 
 		 641 aa  500  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  44.31 
 
 		 633 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  44.31 
 
 		 632 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  46.02 
 
 		 598 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  44.54 
 
 		 632 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  45.07 
 
 		 611 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  44.64 
 
 		 633 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  43.9 
 
 		 633 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  45.43 
 
 		 621 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  43.32 
 
 		 645 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  44.18 
 
 		 635 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  44.94 
 
 		 611 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  44.13 
 
 		 633 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  43.21 
 
 		 648 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  43.77 
 
 		 636 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  44.82 
 
 		 626 aa  469  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  40.72 
 
 		 630 aa  451  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  39.3 
 
 		 574 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  39.45 
 
 		 575 aa  438  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  40.09 
 
 		 643 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  38.24 
 
 		 632 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  41.69 
 
 		 606 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  39.67 
 
 		 595 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  40.03 
 
 		 644 aa  402  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  39.67 
 
 		 595 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  42.16 
 
 		 612 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  40.98 
 
 		 616 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  40.48 
 
 		 618 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  41.37 
 
 		 632 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  40.12 
 
 		 597 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  39.91 
 
 		 599 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  39.67 
 
 		 595 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  40.49 
 
 		 603 aa  389  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  39.67 
 
 		 597 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  39.37 
 
 		 643 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  39.28 
 
 		 626 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  39.03 
 
 		 610 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  38.21 
 
 		 633 aa  382  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  39.7 
 
 		 629 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  38.72 
 
 		 603 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  39.18 
 
 		 594 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  39.51 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  37.59 
 
 		 623 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  38.52 
 
 		 602 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  39.73 
 
 		 621 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  37.59 
 
 		 623 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  38.66 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  52.52 
 
 		 688 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  38.38 
 
 		 620 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  39.1 
 
 		 621 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  38.44 
 
 		 600 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 		 611 aa  365  2e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  39.28 
 
 		 671 aa  363  8e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  39.15 
 
 		 687 aa  362  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  54.73 
 
 		 687 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  35.05 
 
 		 647 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  38.33 
 
 		 607 aa  357  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  37.83 
 
 		 600 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  39.48 
 
 		 648 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>