More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2773 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2773  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  841    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4311  putative metal dependent phosphohydrolase  40.53 
 
 		 408 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2647  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 		 385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.427362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1357  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4051  HD-GYP domain-containing protein  30.31 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4666  putative metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 		 403 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0258  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 		 375 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0373  putative metal dependent phosphohydrolase  31.95 
 
 		 410 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1003  putative metal dependent phosphohydrolase  25.42 
 
 		 423 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2242  putative metal dependent phosphohydrolase  30.8 
 
 		 333 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2752  putative metal dependent phosphohydrolase  30.8 
 
 		 333 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0489  HD-GYP domain-containing protein  28.12 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3466  putative metal dependent phosphohydrolase  30.62 
 
 		 330 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4783  putative metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0983875  normal  0.561862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2795  hypothetical protein  30.56 
 
 		 331 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2693  HD-GYP domain-containing protein  29.79 
 
 		 319 aa  123  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1852  putative metal dependent phosphohydrolase  28.62 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  24.38 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 		 418 aa  92.8  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  31.87 
 
 		 420 aa  90.1  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 446 aa  89.7  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 		 416 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  27.47 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  28.86 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  30.05 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  24.71 
 
 		 352 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  28.16 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  26.37 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  26.44 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  29.12 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  28.86 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  25.99 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  22.94 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  22.62 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  27.24 
 
 		 377 aa  76.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  27.55 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  23.96 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  25.82 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  25.83 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  29.8 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1837  HD-GYP domain-like protein  29.67 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  27.49 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  22.91 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  27.49 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  26.62 
 
 		 488 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  26.62 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  24.85 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0886  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.286498  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  28.7 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3124  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  22.96 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  25.76 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0563  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  24.46 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  24.5 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  25.3 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  26.88 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  22.79 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1256  HD domain-containing protein  26.34 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0488462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0007  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000616807  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  24.41 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  21.58 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  26.78 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  25.14 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  22.73 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1227  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  25.51 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  25 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>