More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2282 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
237 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  74.22 
 
 
229 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  72.44 
 
 
229 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  71.56 
 
 
229 aa  338  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  70.67 
 
 
229 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41950  enoyl-CoA hydratase  70.22 
 
 
229 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  70.22 
 
 
229 aa  329  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  69.33 
 
 
229 aa  328  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  68 
 
 
229 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  67.11 
 
 
229 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  68 
 
 
229 aa  317  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  56.25 
 
 
252 aa  274  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  57.46 
 
 
230 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  56.33 
 
 
229 aa  256  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.79 
 
 
238 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  42.22 
 
 
233 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  37.95 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0918  enoyl-CoA hydratase  41.78 
 
 
232 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0911  enoyl-CoA hydratase  41.23 
 
 
248 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0928  enoyl-CoA hydratase  41.23 
 
 
248 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  41.78 
 
 
233 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 
231 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.04 
 
 
218 aa  144  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.23 
 
 
235 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  0.778271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.14 
 
 
253 aa  95.1  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  28.94 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.84 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.79 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.87 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.78 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.97 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.11 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.33 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.5 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4169  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.07 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.68 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  31.41 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.84 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.8 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  28.51 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1968  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.73 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.503691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.58 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  24.45 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  24.45 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0408  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.86 
 
 
724 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0436  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.35 
 
 
725 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0145  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.62 
 
 
268 aa  62.8  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0437  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.86 
 
 
725 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05532  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.65 
 
 
256 aa  62.4  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0030451  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.6 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.71 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2453  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  32.58 
 
 
702 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.07 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2829  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.34 
 
 
265 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  25.45 
 
 
262 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2754  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  30.81 
 
 
703 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.693173  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.1 
 
 
273 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 
252 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  25.11 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  29.19 
 
 
267 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  26.26 
 
 
256 aa  58.5  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.16 
 
 
261 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.48 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  24.68 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2067  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  27.31 
 
 
654 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.97 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.67 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  27.41 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1444  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  24.75 
 
 
727 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2377  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
260 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  22.92 
 
 
268 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1839  enoyl-CoA hydratase  26.34 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.952536  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.34 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53207  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1905  enoyl-CoA hydratase  26.34 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.888285  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  26.32 
 
 
657 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4162  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  30.26 
 
 
723 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.19 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  25.96 
 
 
288 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.81 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.11 
 
 
260 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4851  enoyl-CoA hydratase  28.14 
 
 
273 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3890  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  27.86 
 
 
711 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0297605  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4309  enoyl-CoA hydratase  28.7 
 
 
255 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 
257 aa  55.8  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4395  enoyl-CoA hydratase  28.7 
 
 
255 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1547  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  26.9 
 
 
637 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000330184  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.5 
 
 
256 aa  55.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4689  enoyl-CoA hydratase  28.7 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552006  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1789  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.77 
 
 
235 aa  55.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  29.38 
 
 
257 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>