More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1948 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  100 
 
 		 418 aa  847    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  63.64 
 
 		 420 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  61.2 
 
 		 443 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  59.95 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  47.28 
 
 		 496 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  47.29 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  47.42 
 
 		 471 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  46.53 
 
 		 416 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  46.53 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  47.04 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  47.04 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  46.53 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  47.04 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  47.04 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  47.04 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  47.04 
 
 		 577 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  44.69 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  47.52 
 
 		 422 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  46.76 
 
 		 438 aa  338  8e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  46.04 
 
 		 416 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  46.04 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  44.09 
 
 		 423 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  44.09 
 
 		 423 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  43.84 
 
 		 423 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  46.29 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  44.72 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  43.46 
 
 		 417 aa  329  7e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  46.04 
 
 		 416 aa  328  9e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  43.55 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  44.01 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  46.94 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  43.52 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  43.46 
 
 		 417 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  44.61 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  43.6 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  47.16 
 
 		 432 aa  323  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  43.21 
 
 		 421 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  42.47 
 
 		 424 aa  322  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  44.94 
 
 		 421 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  43.21 
 
 		 421 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  42.36 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  43.46 
 
 		 418 aa  318  9e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  45.34 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  45.04 
 
 		 415 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  44.55 
 
 		 416 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  45.04 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  39.85 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  43.87 
 
 		 415 aa  309  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  44.1 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  39.8 
 
 		 419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  43.6 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  43.1 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  44.12 
 
 		 415 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  43.6 
 
 		 421 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  38.3 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  37.2 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  37.35 
 
 		 420 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  36.71 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  36.93 
 
 		 412 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  31.28 
 
 		 425 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  31.75 
 
 		 425 aa  216  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  29.86 
 
 		 421 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  34.41 
 
 		 425 aa  209  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  32.94 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  30.97 
 
 		 454 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  29.65 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  36.19 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  33.81 
 
 		 430 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0674  HSP70 family molecular chaperone  35.45 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370304 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  30.11 
 
 		 450 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  33.51 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  32.24 
 
 		 456 aa  180  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  31.59 
 
 		 456 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  32.23 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  32.23 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  32.23 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  34.58 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  29.12 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  30.62 
 
 		 450 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  28.64 
 
 		 424 aa  169  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1199  putative chaperone protein DnaK  31.84 
 
 		 440 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.574359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  31.48 
 
 		 440 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  30.47 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  30.47 
 
 		 450 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  35.06 
 
 		 461 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  28.16 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  30.26 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4817  HSP70 family molecular chaperone  30.93 
 
 		 438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  29.05 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  30.26 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  30.04 
 
 		 450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  30.04 
 
 		 450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  31.2 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  30.04 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2182  hypothetical protein  30.11 
 
 		 447 aa  163  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107974  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  30.04 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  28.6 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  32.25 
 
 		 475 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  33.78 
 
 		 457 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  31.2 
 
 		 450 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.690731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>