More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5982 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C5982  Iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
372 aa  756    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.306668  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5421  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.47 
 
 
372 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 
340 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
380 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 
417 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 
354 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
379 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 
353 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.89 
 
 
352 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
357 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5141  putative alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 
386 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237581  normal  0.0395804 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 
355 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  26.72 
 
 
352 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.52 
 
 
355 aa  93.2  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 
355 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1062  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
314 aa  92  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 
356 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
356 aa  89.7  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.91 
 
 
848 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.19 
 
 
358 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  29 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.01 
 
 
352 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
352 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  29 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.23 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  27.88 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.51 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
352 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.41 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.34 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3534  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.21 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  26.09 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.82 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2344  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.56 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1050  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.38 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.77 
 
 
363 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0927  L-1,2-propanediol oxidoreductase  23.18 
 
 
382 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0355578  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05234  Fe-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06800)  28.99 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.868028  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.03 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.09 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0904  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.35 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  23.61 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1046  L-1,2-propanediol oxidoreductase  23.84 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.968246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  27.15 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.52 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.61 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.161806 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2322  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  24.52 
 
 
904 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.05 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1499  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.13 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.79 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  24 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5476  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.15 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377553  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1052  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.74 
 
 
872 aa  69.7  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1426  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3279  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.83 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0202  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3574  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.5 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.882397  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1518  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.47 
 
 
863 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000499783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  24.65 
 
 
887 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.38 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.61 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  22.77 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  26.91 
 
 
357 aa  67  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1004  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.22 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0330  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.24 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.397984 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.86 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549318  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.84 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  23.84 
 
 
383 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.57 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3198  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  22.16 
 
 
867 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  23.59 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.59 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  23.59 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  23.59 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  25.7 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4050  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  25.48 
 
 
894 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0532224 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.57 
 
 
384 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  23.59 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0211  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.85 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1934  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.57 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0946  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  23.59 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  20.39 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  23.92 
 
 
383 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1495  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  22.6 
 
 
863 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.15 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1421  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.73 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>