60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2673 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2673  hypothetical protein  100 
 
 		 698 aa  1361    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.749079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2546  hypothetical protein  56.93 
 
 		 676 aa  502  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000686535  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3009  transcriptional regulator-like protein  55.9 
 
 		 695 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  39.73 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  44.12 
 
 		 301 aa  57  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  51.67 
 
 		 320 aa  56.2  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1959  Helix-turn-helix type 11 domain protein  50 
 
 		 234 aa  53.9  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2388  hypothetical protein  42.19 
 
 		 606 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2436  hypothetical protein  42.19 
 
 		 606 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  35.77 
 
 		 511 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  35.77 
 
 		 511 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  26.67 
 
 		 320 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  28.3 
 
 		 349 aa  52  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0327  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.29 
 
 		 339 aa  50.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4034  transcriptional regulator-like protein  42.42 
 
 		 322 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  30.56 
 
 		 317 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  43.75 
 
 		 323 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  42.42 
 
 		 322 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  40.3 
 
 		 361 aa  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3062  Helix-turn-helix type 11 domain protein  42.86 
 
 		 313 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.752018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  34.86 
 
 		 330 aa  50.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  39.51 
 
 		 324 aa  50.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  37.35 
 
 		 229 aa  49.7  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  25.83 
 
 		 320 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  40.58 
 
 		 367 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  26.72 
 
 		 320 aa  48.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  29.46 
 
 		 325 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  26.72 
 
 		 320 aa  48.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  40.58 
 
 		 369 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  40.58 
 
 		 364 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  36.14 
 
 		 326 aa  47  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35620  predicted transcriptional regulator  30.71 
 
 		 241 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  39.39 
 
 		 687 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  42.62 
 
 		 326 aa  47.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  30.99 
 
 		 339 aa  47.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  25.86 
 
 		 320 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.77 
 
 		 327 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5102  hypothetical protein  26.04 
 
 		 609 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  42.86 
 
 		 663 aa  46.2  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  39.06 
 
 		 347 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  29.41 
 
 		 326 aa  45.8  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  28.89 
 
 		 341 aa  45.8  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5074  hypothetical protein  36.49 
 
 		 210 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  40 
 
 		 323 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.68 
 
 		 315 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  38.71 
 
 		 321 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1789  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.18 
 
 		 333 aa  45.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  normal  0.195591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.19 
 
 		 321 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 304 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.5 
 
 		 324 aa  44.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  35.8 
 
 		 361 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 369 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  40 
 
 		 345 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.3 
 
 		 298 aa  44.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.94 
 
 		 299 aa  44.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  31.93 
 
 		 326 aa  44.3  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  34.78 
 
 		 337 aa  44.3  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  38.03 
 
 		 336 aa  44.3  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  33.33 
 
 		 351 aa  43.9  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  39.06 
 
 		 240 aa  43.9  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>