More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0983 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0429  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  88.8 
 
 
386 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413343  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0983  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  100 
 
 
384 aa  755    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1143  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  59.74 
 
 
388 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.525995  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3870  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  56.4 
 
 
384 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  40.52 
 
 
388 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  43.15 
 
 
386 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  40.83 
 
 
388 aa  268  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  40.16 
 
 
387 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  40.41 
 
 
390 aa  260  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  40.81 
 
 
388 aa  258  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  39.28 
 
 
387 aa  256  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  39.48 
 
 
388 aa  256  7e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  41.09 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  40.16 
 
 
387 aa  238  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  36.64 
 
 
392 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  34.86 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  36.64 
 
 
392 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  36.39 
 
 
392 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  36.39 
 
 
392 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  37.34 
 
 
387 aa  206  7e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  34.55 
 
 
390 aa  192  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.43 
 
 
392 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.4 
 
 
388 aa  190  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.43 
 
 
392 aa  190  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1084  acetyl-CoA C-acyltransferase  34.67 
 
 
368 aa  188  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  33.33 
 
 
387 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.33 
 
 
387 aa  187  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.91 
 
 
392 aa  186  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0795  acetyl-CoA C-acyltransferase  33.24 
 
 
369 aa  185  9e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  32.9 
 
 
394 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.85 
 
 
388 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0813  acetyl-CoA C-acyltransferase  33.69 
 
 
368 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000183957 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1358  acetyl-CoA C-acyltransferase  32.27 
 
 
368 aa  177  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  35.66 
 
 
388 aa  176  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.25 
 
 
384 aa  176  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.77 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  33.25 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.42 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  33.77 
 
 
387 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  35.14 
 
 
388 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  32.37 
 
 
395 aa  171  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  34.03 
 
 
396 aa  171  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  33.85 
 
 
388 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  33.42 
 
 
386 aa  169  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  31.94 
 
 
384 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1242  acetyl-CoA C-acyltransferase  30.87 
 
 
380 aa  168  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0529567  normal  0.0106911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  32.38 
 
 
386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.85 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.94 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  32.7 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  32.32 
 
 
390 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.54 
 
 
397 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  34.04 
 
 
392 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.04 
 
 
391 aa  160  5e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.95 
 
 
413 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  30.9 
 
 
407 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  34.04 
 
 
383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  30.71 
 
 
413 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  30.71 
 
 
413 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  31.94 
 
 
392 aa  155  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.65 
 
 
394 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.39 
 
 
387 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  29.9 
 
 
413 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  30.05 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  29.9 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  31.51 
 
 
387 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  30.36 
 
 
382 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.58 
 
 
376 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.15 
 
 
378 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1608  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoAthiolase) (AcaB-1)  29.33 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  32.1 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  28.42 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.39 
 
 
395 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  30.71 
 
 
394 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 
460 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  32.98 
 
 
384 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1647  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  29.68 
 
 
360 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2763  putative SCP-x_thiolase/acetyl- CoA acetyltransferase, PaaJ-like  33.55 
 
 
400 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470356  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  27.65 
 
 
404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.55 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  29.5 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  28.75 
 
 
413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.5 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.93 
 
 
378 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.91 
 
 
398 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  30.65 
 
 
397 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  31.73 
 
 
389 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  30.37 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  34.39 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  31.12 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  32.8 
 
 
384 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  31.55 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  32.59 
 
 
395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  33.55 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  30.41 
 
 
384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.21 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  30.53 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  37.08 
 
 
393 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  30.75 
 
 
399 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  32.57 
 
 
385 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>