More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0243 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0243  putative transcriptional regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 310 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5619  LysR family transcriptional regulator  69.26 
 
 		 309 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.272511 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6075  LysR family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 309 aa  434  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3428  LysR family transcriptional regulator  68.71 
 
 		 309 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4089  LysR family transcriptional regulator  68.71 
 
 		 309 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00576111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5211  LysR family transcriptional regulator  66.77 
 
 		 309 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3373  LysR family transcriptional regulator  66.45 
 
 		 309 aa  427  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2741  LysR family transcriptional regulator  66.77 
 
 		 309 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3912  LysR family transcriptional regulator  62.9 
 
 		 309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26390  LysR family transcriptional regulator protein  56.25 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6127  transcriptional regulator, LysR family  48.87 
 
 		 316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  34.22 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 303 aa  188  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  34.44 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  33.66 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  32.66 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.78 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.67 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4096  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0830  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.588944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37120  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0187077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  31.05 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3064  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3137  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0877  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 329 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.795779  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2690  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0797  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.433602  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2050  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2661  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.583907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3196  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00241672  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2362  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.56 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0686  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 301 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4209  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 302 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 294 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 294 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1984  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 303 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 299 aa  158  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0155  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0458494  normal  0.226334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0430  transcriptional regulator, LysR family  32.79 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0593  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0225  transcriptional regulator, LysR family  32.69 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1543  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  33.87 
 
 		 367 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4684  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.97 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  32.01 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1221  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 309 aa  155  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  30.9 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 296 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>