63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4238 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  100 
 
 		 1136 aa  2325    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  29.04 
 
 		 900 aa  253  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  26.13 
 
 		 938 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  23.22 
 
 		 939 aa  163  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  22.54 
 
 		 937 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  22.54 
 
 		 937 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  23.3 
 
 		 942 aa  159  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  23.65 
 
 		 935 aa  157  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  23.42 
 
 		 937 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  23.29 
 
 		 936 aa  154  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  23.76 
 
 		 1051 aa  154  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  25.2 
 
 		 940 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  26.63 
 
 		 923 aa  148  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  26.43 
 
 		 924 aa  147  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  21.06 
 
 		 919 aa  145  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  24.81 
 
 		 923 aa  142  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  23.3 
 
 		 931 aa  132  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  23.48 
 
 		 960 aa  127  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  24.15 
 
 		 1015 aa  99.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.554072 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  21.16 
 
 		 1313 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0305  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1205 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0189  type IV conjugative transfer system protein TraG  23.3 
 
 		 1204 aa  77.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0243  hypothetical protein  23 
 
 		 1199 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  21.32 
 
 		 1093 aa  73.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1594  sex pilus assembly  22.28 
 
 		 1145 aa  71.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1369  hypothetical protein  33.78 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  29.41 
 
 		 214 aa  57.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  32 
 
 		 267 aa  56.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  34.38 
 
 		 234 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  36.21 
 
 		 310 aa  52.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  30.87 
 
 		 270 aa  52.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  30.61 
 
 		 242 aa  51.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  30.34 
 
 		 267 aa  50.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  30.77 
 
 		 228 aa  50.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  36.19 
 
 		 286 aa  49.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  34.29 
 
 		 546 aa  48.9  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  27.78 
 
 		 241 aa  48.9  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  39.39 
 
 		 247 aa  48.5  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  19.95 
 
 		 922 aa  48.5  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3767  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1124 aa  48.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.635002  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  32.14 
 
 		 179 aa  48.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.88 
 
 		 253 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  37.88 
 
 		 253 aa  47  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  37.88 
 
 		 253 aa  47  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  29.05 
 
 		 240 aa  47.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.88 
 
 		 253 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18530  hypothetical protein  38.33 
 
 		 170 aa  47  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.711957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  30.5 
 
 		 228 aa  47  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.88 
 
 		 253 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.88 
 
 		 253 aa  47  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.88 
 
 		 259 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  29.05 
 
 		 240 aa  47  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.88 
 
 		 259 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  29.37 
 
 		 228 aa  47  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.88 
 
 		 259 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  37.88 
 
 		 259 aa  47.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  34.23 
 
 		 233 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  28.97 
 
 		 255 aa  46.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  28.97 
 
 		 165 aa  46.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  29.17 
 
 		 197 aa  45.8  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  45.28 
 
 		 201 aa  45.8  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5334  hypothetical protein  33.66 
 
 		 300 aa  45.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632965  normal  0.811239 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  30.2 
 
 		 242 aa  44.7  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>