23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4618 on replicon NC_009999
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  84.13 
 
 		 937 aa  1624    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  83.99 
 
 		 942 aa  1625    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  84.03 
 
 		 937 aa  1639    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  100 
 
 		 939 aa  1952    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  84.03 
 
 		 937 aa  1639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  84.35 
 
 		 936 aa  1628    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  42.73 
 
 		 931 aa  607  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  28.59 
 
 		 1051 aa  281  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  28.03 
 
 		 935 aa  276  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  26.14 
 
 		 960 aa  258  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  27.56 
 
 		 940 aa  258  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  26.35 
 
 		 919 aa  222  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  24.31 
 
 		 900 aa  158  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1136 aa  155  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  24.39 
 
 		 938 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  25.17 
 
 		 1313 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  24.66 
 
 		 1015 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.554072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  21.68 
 
 		 923 aa  97.8  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  21.79 
 
 		 924 aa  76.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  22.24 
 
 		 923 aa  75.1  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  21.75 
 
 		 922 aa  57  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  20.31 
 
 		 1093 aa  48.9  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0376  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1172 aa  48.1  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>